据台湾媒体十三日报道，在发生三·一九枪击事件后，五·二0“就职典礼”的安全问题备受关注。“国安局”特勤中心执行长许立孟上午在“立法院”表示，为了保护“元首”安全，中心当天使用三组系数为A3、可以抵挡狙击枪攻击的防弹玻璃，每组价格四十万元，总共花费一百二十万元；“国安”、警政官员指出，虽然有接获五·二0遥控飞行器攻击情报，但迄今并无具体线索。

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　　另外，“国安局”将视当天状况建议陈水扁穿防弹衣。

　　此外，三·二0选举前进驻台北市的十二辆刺针导弹发射车，原本计划在“选举”完后就撤回，但为防制五·二0可能突发的攻击事件，军方特别下令这批导弹车继续驻守台北市区。