根据国家环境保护总局、监察部、交通部、农业部的联合部署，国家海洋环境保护联合执法检查组日前对海南省执行海洋环境保护法的工作进行了为期4天的检查。“海南海洋环境令人亦喜亦忧，强化保护工作任重而道远。”这是检查组对海南的总体评价。
海南省委、省政府高度重视环境保护工作，始终坚持走可持续发展之路，使全省80％以上的海域海水达到国家一、二类水质标准。
为加强法规建设，海南省先后制定了《海南省环境保护条例》、《海南省红树林保护规定》、《海南省珊瑚礁保护规定》等20多部环境保护的地方性配套法规和规章，为海洋环境保护工作提供了充分的法规依据。
为保护近岸海域环境，海南省严格按照所制定的《海南省近岸海域环境功能区划》对近岸海域环境的要求，合理布局海岸工业，从宏观上保障了近岸海域环境的质量。
为加大沿海城镇的环境基础设施建设力度，海南把全省12个沿海市县城镇的生活污水处理纳入省“十五”计划中；加强港口、码头、船舶污水及垃圾的处理；启动农业面源的监控和治理工作，并推广无公害农业生产和农业标准化建设。
联合检查组指出，海南省生活污水是当前海洋环境污染物质的主要来源，城市市政污水处理系统在设施的建设进展、设施处理效能、污水管网改造和建设方面，目前还不能满足海洋环境保护的要求。同时，作为生态环境良好的旅游大省，港口码头溢油应急器材和材料储备不足以应付重大海上污染事故，包括化学品污染事故对海洋环境的污染冲击。渔港水域及其岸边作业区域缺乏必要环境管理措施，污染环境的现象比较严重。高位养殖环境保护监督管理力度不够，对分布于海岸上的诸多零散养殖池的生产污水排放问题得不到有效的控制。
对此，联合检查组要求，海南省要加快市政污水处理系统的建设速度，要积极引入BOT、TOT等市场化操作机制，同时，要注意解决好建设投资与运营经费等财政机制问题，推进市政污水处理系统的建设；建立和完善海上溢油应急反应体系，防止和减轻因船舶和岸边设施溢油（化学品）事故对海洋造成的污染损害；采取有效措施改善渔港的环境质量；加强对高位养殖排放废水的监督管理，提倡科学、环保的生产方式。
近年海南省海岸的开发利用日益增长，给近岸海域水质和渔业港口的生态环境增加了压力。为此，该省开展了重点海洋开发区环境综合整治，先后完成了陵水县新村港、万宁市东澳小海和琼海市谭门港等渔港的整治，规范其污水排放口和治污达标排放，清理各种垃圾，对垃圾进行规划集中处置，使上述渔港的水质由三类水质恢复为二类水质。目前，海口湾和三亚湾的环境整治正在积极进行中。岛内12个沿海市县均有养殖场或养殖基地。统计表明，全省现有海水养殖面积24.6万亩，其中对虾养殖面积15万多亩。而且养殖水平较低，高科技集约化养殖场面积仅占有1％，约25％左右的高位池无防渗措施，养殖废水大部分未经处理直排入大海。全省高位池养殖废水排放总量约1.7亿吨／年，主要污染物浓度全部超过国家《污水排放综合标准》，养殖场排放口附近的海水水质由原二类下降为四类，还造成海防林、红树林等海岸生态系统破坏。海南省正在着手研究可行的治理技术。
此外，全省2000～2002年化肥和农药的使用量分别为211万吨和3.72万吨，造成海洋环境污染。同时全省现有大型集约化养殖场21家、中小型养殖场40多家。不少养殖场分布在沿海地区，对海洋环境也构成一定的威胁。
