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大部分科研力量游离于企业和市场之外，导致科技与经济相互脱节，进而造成科技成果转化难、企业技术创新少、自主开发能力弱。如何破解困扰科研院所的科技与经济“两张皮”的难题？青海省科技厅积极探索，大胆尝试，取得了突破性的进展，特别是公益型科研机构的改革走在了国内同行的前列。
科研院所转制，目标指向十分明确，就是“事业变企业”。青海省省属科研机构管
理体制改革从1999年下半年开始，历经调研、起草方案、制定政策、召开动员大会、出台安排意见、培训，以及各科研院所制定改革方案、对方案下达批复、完成工商注册登记和挂牌等步骤。到2000年底，省属25家科研机构管理体制改革提前1年完成，除4家转制为医疗单位和社会中介服务单位，2家进入大学，其余18家均转制为科技型企业或科技型服务企业，并从2001年1月1日起按企业机制运行。2001年8月，国家经贸委所属的西宁高原工程机械研究所实行属地化管理，随后完成改企。毋庸置疑，这是一场改变旧体制，冲破旧模式的“脱胎换骨”式的改革，也正是有了这样的改革，才有可能从根本上解决科研与生产紧密相连的问题，才有可能极大地挖掘科研生产力。
解决问题，最终要靠深化科技体制改革，即不光转机，还要建制。面对科研院所转制过程中的种种困难，光靠输血是不行的，最根本的问题是激活造血机能，而最大的潜力就蕴藏在广大科研人员当中。于是，在青海省科研院所中，课题、项目负责制，以及人员双向选择、优化组合的竞争激励机制使科技动力应运而生，大家纷纷出去找米下锅，主动面向经济建设主战场，面向生产实践第一线，项目多了，经费多了，成果多了，收入也多了。通过近几年来的改制，不仅绝大多数的改企单位在人事上试行了全员聘用制，分配上试行了绩效工资制，财务上试行了现代企业成本核算制，调动了科研人员的积极性和主观能动性；而且各改企单位依托优势，明确定位，多头并进，谋求发展，取得了明显的经济和社会效益。
科研机构实现转制,仅仅是由事业单位转变为国有科技型企业。要建立现代企业制度,实现产权的多元化,尚有很多工作要做。2001年元月，青海省专门组建了省国有科技资产经营管理有限公司，行使国有科技资产的保值增值等出资人的权利，并于2002、2003年先后安排2批共10家改企科研机构进行产权多元化试点。截至2003年底，省高原工程机械科技发展公司、省水利水电科学研究所、省煤矿设计研究院和省公路科研勘察设计院4家单位完成了股份制改造，其中省高原工程机械科技发展公司于今年元月份正式挂牌，职工个人股占总股本的82%，18%的国有法人股由省国有科技资产经营管理有限公司持股管理。为适应国际化的市场经营模式，今年我省将在科技型企业全面推进现代企业制度的同时，积极探讨年薪制、期权制、任务承包一次性奖励等新的分配制度，促进开放、流动、竞争、协作新机制的建立。
实践证明，转企改制为科研院所注入了活力。改企后，各科研院所市场竞争意识、创新创业意识明显增强，并努力把科研优势转化为产业优势，形成新的经济增长点。省高原工程机械科技发展公司不仅申请到了建筑业企业机电设备安装工程专业承包三级资质，申报成立了“国家高原机械工程技术中心”，通过了国家认监委、中国机械联合会的计量认证，而且全年光技术服务性收入就达到了170万元；省建筑建材科学研究院新增室内环境污染检验业务，当年实现产值200万元，成为该院新的增长点。省化工研究院通过技术入股与青海盐湖化工公司合作，建立新型3#浮选剂生产装置，当年完成产值90万元。继2002年4家改企科研机构取得质量体系认证后，省煤矿设计院和省环科所也于2003年分别取得质量管理体系认证、环境质量体系认证。
与此同时，改企科研院所在产业科技进步中的作用进一步增强，科技创新服务能力不断提升。据统计，2003年改企科研院所在水利、建筑、环保、农业、机械、化工等行业共承担国家级、省级科研项目110多项,经费超过1600万元，其中10%以上的科研项目与外省有合作关系。如省水利水电科学研究所与中科院地理所、中科院西北高原生物所、北京林业大学等单位进行合作，承担的科技部“十五”重点科技攻关项目“柴达木盆地农田与草地退化植被恢复技术示范研究”已通过国家验收，还承担了国家质检总局、水利部和省科技厅下达的科研课题7项，经费达800万元。省高原工程机械科技发展公司拓宽技术服务领域，研制的两用畜牧暖棚在环青海湖畜牧业示范基地中应用，被认为是传统暖棚的升级换代产品。省新能源研究所连续三次中标国家“西部省份无电乡工程”光伏电站建设项目，争取到3.68亿元的项目资金，在国内同行中实属罕见。
科研院所经过三年的改企、转制，已在市场经济中生存并发展起来，并从根本上扭转了科研机构游离于经济建设之外的状况，实现了科技与经济的结合。据统计，2003年全省科研机构共争取并实施科研、开发、推广项目157个，获得项目经费6247.2万元,实现技工贸收入1.5亿元,与改企前的2000年相比翻了两番多；上缴税金492.8万元,交纳职工社会保险654.1万元,职工人均收入2.7万元,年均增长20%以上,固定资产增值843.1万元；尤其是科研机构的经济结构发生了根本性转变，财政补助性收入占年度收入的比重已由改制前的70%降到2003年的15%左右，技术性收入已成为收入的主体。在职人数也扭转了连续两年的下降趋势，增长了30%，且在岗人员中的聘用人员已占到1/4。
