由中科院南京土壤研究所承担、国家自然科学基金资助的重点研究项目之一——“南京市历史文化层中土壤重金属元素的分布规律初探”研究证明：近现代、明清、六朝3个历史时期，南京土壤中重金属污染呈增高趋势，局部地段有巨量增高。有关专家接受记者采访时表示，在目前大规模城市建设中，这些被污染的土壤如果被随意处置，将变成“环境杀手”。
中科院南京土壤研究所研究员、国际土壤学会土壤发生委员会副主席张甘霖博士告诉记者，这项研究对南京城区两个区域多个文化层中土壤重金属含量分布进行了研究，一个区域是位于明故宫以西的中山东路大行宫地区、长江路总统府旁、太平南路；另一个区域是靠近秦淮河流域的三山街金沙井、弓箭坊、朝天宫以东等。研究人员对不同年代的土壤里铜、铅、锌的含量进行测定后发现，除了近现代期重金属污染加剧外，六朝、明朝早期和清朝中晚期三个阶段，重金属含量异常增高。专家分析，六朝时期是历史上南京早期较发达时期，而整个社会正陷于连年战争，导致手工业兵器制造业的高速发展，造成城市土壤污染；明朝早期南京造船业十分发达，船只的修理、改造加之商贸发达；清朝中晚期近现代工业长足发展，这些人类活动都是造成土壤重金属污染的原因。
专家研究还发现，在空间分布上，上述两个区域重金属含量有明显差异。明故宫一线历史上主要是六朝、明朝时期的皇宫所在地，文化层中重金属含量很少；而三山街一线则是作坊林立的工业区、商贾云集的商业区和普通大众的生活区，重金属含量是前者的2—8倍。
历史文化层中被重金属污染的土壤深埋在地下，通常对环境并不会造成危害，但在大规模的城市建设中，这些被污染的土壤往往成为废弃渣土，处置不当就成了“环境杀手”。张甘霖介绍说，研究发现，这些被污染的土壤除了含有重金属外，还含有极高的磷，有的含有有机污染物等。由于目前城市管理中并没有开展对废弃土壤的污染状况评价，很多渣土被弃置在城郊接合部，其中的污染物通过水的渗透会污染地表和地下水，被农作物吸收后可能通过食物链对人体健康造成危害，附着在可吸入颗粒物上则污染空气。除了这些显而易见的危害外，还会破坏当地的生态系统。2007年前，南京将搬迁主城内所有污染企业，置换出来的土地究竟污染状况如何？是否适合居住或者其他用途？专家呼吁，及早开展土壤污染状况评估，对被污染的土壤分类处置，污染严重的土壤要作为固体废弃物加以处理，以减少对生态和环境的危害。
