对于台商自发向当局联合建言，发表《台商宣言》的举动，有岛内分析人士在接受采访时表示，《台商宣言》是对陈水扁现行两岸政策的反弹，这反映了台商希望两岸“双赢”的思维。
台湾《投资中国》信息网社长李孟洲先生指出：台商的这一举动对台当局的两岸经贸政策会有刺激的作用，“让他们知道民意有这样一个强大的需求”。而对于陈水扁所强调
的所谓“积极管理”政策，他认为，这应该只是一种政治性的宣示，在经济实务上来讲，并不太容易落实。
作为大陆台商组织，中国台商发展促进协会一直在推动两岸交流和台商权益保障。协会秘书长詹清池先生表示，他们非常了解台商的心声，但在现阶段两岸环境下，两个比较可行的重要议题就是包机的常态化，不管是货运还是客运；以及两岸在观光上的加强交流，“这种交流不光只是大陆人士来台观光，台湾的民众到大陆去观光也应该要有一个更便捷的方式。”
而台北大学公共行政系教授江岷钦在接受采访时认为，《台商宣言》是对陈水扁现行两岸政策的反弹。他指出：目前两岸关系不能够有效打开，有一部分是因为双方在互信的基础上有待加强，但是台湾领导人在整个两岸关系政策上面依然透过比较急燥的方式，采取“锁国”政策更是愚不可及的。陈水扁如果采取一意孤行的方式，人民会反弹，台商只是其中之一，这是透过人民的声音，向当局表达不满，也让国际社会看到两岸人民、特别是台湾人民在整个两岸关系上有一些期待的声音出现。
