中新社上海三月一日电针对陈水扁强行决定终止“国统会”运作和“国统纲领”适用，中共中央台湾工作办公室、国务院台湾事务办公室受权发表声明揭露了陈水扁挑衅台海和平、制造两岸紧张的险恶用心，同时，再一次表达了祖国大陆从台湾民众利益出发，争取和平统一，反对“台独”的坚定决心。对此，此间媒体报道了上海研究台湾问题的专家、学者的强烈反应，他们指出，陈水扁逆时而动终为世界所弃，如意算盘必成泡影。上海国际问题研究所副所长杨洁勉说，陈水扁于二月二十八日公文批示终止“国统会”运作和“国统纲领”
适用，是在“台独”的死胡同里又跨出了危险的一大步。陈水扁试图通过此举实现其“法理台独”，不仅再度造成两岸关系的紧张对峙，还威胁到台海地区及亚太地区的和平与稳定。事实证明，祖国大陆“一国两制、和平统一”的方针，得到了向往和平与发展的国家和人民的普遍支持。陈水扁蓄意破坏两岸积极交往的发展势头，与和平发展的世界潮流背道而驰，最终必将为世界所弃。
上海社会科学院台湾研究中心秘书长王海良认为，陈水扁的如意算盘是以推进“法理台独”谋取在“台独基本教义派”中的地位，同时挑起族群争斗，煽起统“独”烽烟，为民进党赢得二00八年选举创造条件。但这只能是一厢情愿，台湾在野党有识之士是不会落入陈水扁的圈套的，国民党、亲民党“立委”已提出罢免陈水扁，丧失了政治信誉的陈水扁已经没有多少政治资本可以运用了。
上海东亚研究所所长助理胡凌炜则表示，自陈水扁上台以来，为其一己之私，不断制造两岸的对峙与紧张，为“台独”势力拓展社会基础。然而，二00五年，随着连宋相继访问祖国大陆，祖国大陆陆续推出一系列有利于台湾民众的政策，使广大台湾民众认识到台湾的经济发展离不开大陆。台湾民众对建立和谐健康两岸关系的诉求瓦解了“台独”势力赖以生存的社会基础。陈水扁决定终止“国统会”运作，目的是继续制造两岸的紧张与对峙，为“台独”势力找回生存空间。
浦东台湾经济研究中心秘书长盛九元指出，从“一边一国”到“宪改”、从“积极管理，有效开发”到“废统”，陈水扁之流一直行进在“台独”的不归路上。陈水扁执意推行激进“台独”路线，在台湾内部和两岸之间全面挑起对抗冲突，只能进一步给台湾经济、社会带来灾难。
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