加入网格计算 寻找非典解药——访旅美华人许田 | |
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http://www.sina.com.cn 2003年05月14日10:18 中国新闻网 | |
只要你是一位能上网的个人电脑用户,就有机会为早一天找到对抗非典型肺炎的特效药贡献一份力量,为人类在与非典病毒的赛跑中增加一份优势。你所需要付出的,只是电脑闲置不用的时间。 旅美华人科学家、耶鲁大学医学院遗传学助理教授许田参与领导的D2OL网格计算项目,最近将非典病毒列为运算目标之一,希望能集大量个人电脑之力形成一台虚拟的超级计算机,加速进行抗非典药物的筛选。 希望参与这个项目的个人电脑用户,只需到“WWW.D2OL.COM”网站下载并安装一个软件。该软件名为“药物设计优化实验室”,简称D2OL。它启动后以后台方式运行,利用电脑的闲置运算能力工作,自动从网站获取数据包,运算完成后自动发送回去,一般不需要用户干预。 网格计算是在个人电脑普及和互联网发展的基础上产生的一种新型运算方式,它通过网络联合众多个人电脑的力量,利用这些电脑的闲置运算能力来解决需要大量科学运算的问题。 D2OL网格计算项目由美国罗斯伯格儿童疾病研究所主持,该研究所是一家非营利科研机构,许田是研究所科学顾问委员会主席,他同时也是上海复旦大学的访问教授,在这次非典疫情发生过程中主动请缨参加上海市的科研攻关。 许田在接受新华社记者电话采访时说,D2OL项目筛选出比较有希望成为抗非典药物的化学物质后,复旦大学的科学家将在实验室中将这些物质作用于导致非典的冠状病毒,观察实际效果。此外,运算结果还将立即在网上无偿公开,供全世界所有研究者共享。 D2OL项目于二○○二年上半年启动,起初的运算目标是埃博拉病毒、炭疽热杆菌和天花病毒。由于最近几个月来非典在世界范围内蔓延,许田和他的美国同事们决定将导致非典的冠状病毒加入运算目标之列,并作为目前的工作重点。自非典部分的运算四月十七日启动以来,截至五月十日,参与D2OL项目的个人电脑已由原先的二点九万台增加到五点五万台。 许田说,以生物学为基础,通过互联网利用个人电脑的闲置时间来进行计算机筛药,是近几年才出现的一种研制药物的新方法。单独一台个人电脑的能力很微小,但许多电脑结合起来,就能形成非常强大的运算能力。他说,现在参与D2OL项目的五点五万台个人电脑,力量已超过十台最好的超级计算机。 许田说,现在D2OL项目已算出了几种比较有希望的抗非典物质。上海市正在加紧建设进一步研究需要的动物实验室,实验室建成后,科学家将根据积累的运算结果在小鼠身上进行动物试验。 许田认为,现在还不能预期D2OL最终是否能帮人们找到对抗非典的特效药,但面对目前的疫情我们必须进行努力。目前的运算目标只是非典病毒中众多蛋白质的一种蛋白酶,将来还有可能需要对其他蛋白质进行计算,因此需要尽可能多的个人电脑加入进来。 来源:人民日报海外版 作者:王艳红
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