未来五年，是实现全面建设小康社会奋斗目标的奠基阶段，我省高新技术产业必须有新的突破和大的发展。力争到2007年，全省高新技术产业实现年技工贸总收入1000亿元，年均增长13%；高新技术产业园区和产业基地实现年技工贸总收入700亿元以上；发展壮大一批具有较强竞争力的高新技术企业（集团），其中，技工贸总收入超过10亿元的达到12家，超过亿元的达到120家；在计算机软件、电子材料、纳米技术、生物医药、现代中药等领域形成一批拥有自主知识产权的核心技术，开发一批产业化前景明朗、市场潜力大的高新技术产品。
为实现《政府工作报告》确定的未来五年高新技术产业发展要求，我省一方面要继续抓好合肥、芜湖、蚌埠高新区二次创业，把合肥高新区建设成为国内一流的开发区，另一方面将按照“突出产业特色，集成优势企业，形成经济规模”原则，围绕合肥、芜湖、铜陵等重点发展区域，集中力量，培育和打造合肥软件、合肥生物医药、淮南生物医药、芜湖新材料、铜陵电子材料和亳州现代中药六大具有我省特色和优势的高新技术产业基地。
正在建设中的六大高新技术产业基地已初步形成产业优势，具有明显的专业化特点。如进入合肥软件产业基地的企业已达124家，2002年实现销售收入10亿元。龙头企业有科大讯飞、皖通科技、科大恒星等。软件产品除国内市场外，还远销美、加、日、新等海外市场。该基地将在未来几年培育骨干企业10家，其中1至2家企业上市。合肥生物医药产业基地2002年底就拥有较大规模企业20多家，实现产值8亿元。骨干企业有合肥神鹿、安科生物、合肥大安生物公司等。多数企业依靠自身能力研发新产品，有自主创新能力。预计2007年园内生物技术企业达80家，重点培植3至5家骨干企业上市。开发新药品种25个，其中三类以上新药15个，实现产业化项目10个。
除合肥的两个产业基地外，铜陵、淮南、芜湖、亳州的产业基地也具有技术优势和产业竞争力，拥有一批在国内外有一定影响力的龙头企业和一大批中小型技术创新企业及配套企业。拥有铜峰电子、三佳、精达铜材、中金铜箔等高新技术企业的铜陵电子材料产业基地年产值15亿元左右，聚丙烯电工膜、金属化镀膜、交流电容器、特种漆包线的生产技术和生产能力以及电子模具的开发和制造能力均居全国前列。未来将进一步延长产品链，扩大产业规模，把铜陵建成一流的电子材料研发及生产基地。
淮南生物医药产业基地有各类生物医药企业、医疗器械企业、药用包装企业及研发机构40多家，21种产品占国内市场30%以上，今后5年将新建20至30个项目，形成生物医药产业的集聚和规模效应。以海螺型材、鑫科材料两家上市公司为核心的芜湖新材料产业基地PVC型材年产20万吨，为亚洲最大规模；UPVC管材年产6万吨，国内领先；稀土光亮铜杆，2002年产量2.6万余吨，列全国同行业前列。亳州现代中药产业基地依托巨大的药材市场，从单纯药材交易发展到初步形成种植、饮片、单味提取中成药的完整的产业链。中药提取发展势头很好，华佗国药、古井九方两企业均建设了规模较大的中药材水提、醇提生产线，年处理中药材能力在8000吨左右。本报记者汪永安
