我国在世界上首创微生物肥料标准体系。这为确保微生物肥料质量安全、规范微生物肥料生产和质量监督提供了重要的科学依据。据介绍，目前世界上还没有从菌种、生产、使用、质检、包装、储存等全过程的多层面标准构成的标准体系。1994年，我国制定了第一个微生物肥料标准。1999年国家着手建设标准体系。微生物肥料标准体系，是围绕对微生物肥料新产品、新检测方法，菌种安全性及效果评价等方面的系统研究。科研人员构建了由通用标准、使用菌种安全标准、产品标准、方法标准和技术规程5个层面的18个标准。有了这个标准体系，菌种和产品安全标准就有了质的提高。

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