由于地域位置和历史渊源的关系，在外人的眼里，足协和国安似乎一直有些“暧昧”的关系，偏偏历史上的国安和现在的现代又从来不照顾这个老邻居的面子，没少给足协添乱，轮岗换了一届又一届，但是国安一直就是中国足协的一块心病，几年前坊间甚至就有“联赛什么都不怕，就怕国安出事”的笑谈。
2000年国安因为小王涛的红牌一怒要退出中国足坛，李士林当时已经让下面拟好了新闻通稿，准备第二天在北京的各主要地方媒体见报，但是南勇搬出了总局这个救兵，甚至动用了政府关系高层路线，并且许了不少诺，国安也就在24小时内鸣金收兵，之后的几年不少人质疑国字号球队京籍教练过多并且引发了国字号教练竞聘上岗的改革似乎就是那次风波的后遗症。有了这次大风波的免疫，国安和足协的关系便在磕磕绊绊中步履蹒跚地前进，香河基地甚至见证了中国足协和国安关系的一个短暂“蜜月”，此后张帅和杜文辉先后被国字号球队除名，国安都给了足协不少面子，至少是在声势上保持了步调一致，而我们对周宁“中指”事件和张帅的“兴奋剂”事件也从轻发落，还了国安一个人情。
马冰也许是国安俱乐部在与足协的关系史上最不愿提及的人物。在联赛成绩下滑苗头初显时，国安曾经为了维护俱乐部自身利益而试图与中国足协拉近关系，马冰便在这个时候走上前台。由于中国足协内部很多官员都是北京体育大学出身，身为北体足球教研室主任的马冰便被国安俱乐部聘为总经理。遗憾的是每每国安俱乐部自认在联赛中吃了亏，派马冰去足协讨说法时，马冰都是空手而归，连一次讨回说法的记录都没有。放下架子却换不来丝毫好处，这极大地伤害了国安的自尊心。2003年，杨祖武复出，2004年中超元年，马冰彻底离开了国安俱乐部。用回杨祖武，北京国安摆出了一副和中国足协“死磕”的架势，在一通眼花缭乱的抗议被足协照单全收后，周伟新一次有争议的判罚终于成了国安大爷罢赛的导火索。来源：《江南时报》
