根据宁夏回族自治区水利厅水政水资源处组织专家对清水河8个控制断面的采样化验分析，沈家河水库断面和三营镇断面为严重污染，水质均为劣五类。但同心桥断面至汇入黄河的泉眼山断面均为天然水质，清水河受污染水体没有进入黄河。
清水河发源于宁夏固原市原州区南部黑刺沟，流经原州区、海原县、中宁县，在中宁县泉眼山入黄河，全长320公里，是宁夏直接入黄河的最大支流。根据专家们对8个监测断面的采样化验分析，距清水河源头10公里的二十里铺断面，河水清澈见底，各项指标符合三类水质标准；而距源头15公里的三十里铺断面至沈家河水库之间的24公里河道水质污染越往下游越严重。污染源主要来自秋冬季土豆淀粉企业、作坊的加工污水和固原市生活污水。清水河上流来水全部汇入沈家河水库。大量废水的汇入，加上水体不流动，自净能力不能发生作用，水体呈原油状，整个库区散发着恶臭。由于水库没有向下游泄水，不会污染下游河道，也避免了污水汇入黄河造成污染。
另据监测，距清水河源头104公里的三营镇断面水体污染严重，污水主要来自三营造纸厂。水体呈红褐色，还弥漫着造纸麦草纸浆的味道。据专家们介绍，随着清水河流程水量的增加和水体自净，在距清水河源头220公里的同心大桥至汇入黄河的泉眼山一段，水体呈天然水质，没有被污染的迹象。
虽然清水河没有污染黄河，但是清水河治污形势严峻而紧迫。专家建议，相关部门应筹资建设上规模的土豆淀粉加工企业，选用目前吴忠市利通区已有的淀粉加工生产配套制造有机复合肥的先进工艺，利用地面冲洗废水生物膜法处理后实现达标排放；加快固原市污水处理厂的建设进度，该污水厂投入运行后沈家河水库以上断面土豆淀粉加工季节的污染问题将得到解决；同时环保部门要加大执法力度，坚决打击非法排污企业。（来源：宁夏网宁夏日报）
