在城市中宠物的增多和宠物经济的升温的同时，一系列负面影响相伴而生，人们对此也是颇有怨言。
例如，由于相关管理不到位、一些宠物主人的素质跟不上，从而导致猫狗叫声扰民、宠物粪便污染环境现象的出现，噪声干扰了人们的生活，粪便容易让人类感染各种疾病。一些地方宠物检疫办证几乎成为空白，有的人为了便宜，到无证医院去打针，更多者干脆不防疫。不仅如此，还有宠物攻击人类的事故发生。对此，有人指出，首先必须规范宠物养殖，制定适应目前市场状况的相关政策；其次，必须提高宠物主的素质，明确责任，制定动物保护法，给宠物人性化管理。
再有，宠物经济虽见红火，相关税收却未能同步增长。统计资料显示，北京目前大约有10万人养猫养狗，每年的饲养费在2000万元左右。然而相关税收却增幅不大，与市场的火爆形成强烈反差。税务部门应考虑研究制定相应政策和办法，明确宠物概念、种类、范围，加强对宠物消费经营的税收监控。
一些社会学专家认为，不宜过分提倡宠物消费，尤其是在我国，目前还有相当一部分人尚不富裕，宠物经济过度发展，容易使人们心理失衡，引发一系列社会问题。而且，从经济学角度来看，这在某种程度上也是对资源的一种浪费，它的发展应该限定在一定范围内，不应放开，有关部门要加大管理力度，给宠物上笼套，让宠物经济有节制地发展。
