大大小小70多个工地扬起的灰尘、广播电视塔的磁辐射、南京烟厂的空气污染物、秦淮南河等水系的臭水、13大标志性建筑幕墙玻璃的光污染。这些环境污染源已经引起了河西新城建设者们的注意。2005年新年伊始，建邺区拿出了一份《“十一五”环境保护与建设专项规划》，提出要在建设中对上述污染进行控制，将河西新城建成生态城区。烟厂等三企业污染须受控制
由于南京卷烟厂对面楼盘云集，该厂带来的污染究竟怎样尤其引人关注。《规划》中详细记述的检测结果表明，四项空气指标中三项达标。除可吸入颗粒物超过国家二级标准外，二氧化硫、二氧化氮、一氧化碳指标均优于国家二级标准。
但《规划》依然明确提出，新城科技园除保留南京卷烟厂、南京锅炉厂和南京雨润食品公司三家企业外，其它污染企业和村民将分批搬迁。就是这保留的三家企业，南京卷烟厂生产规模将被控制，南京锅炉厂、雨润食品有限公司产生的污染也要进行限期治理，按规定排放。广播电视塔建议搬迁
由于市民对电磁辐射的投诉已经形成了热点，该《规划》认为，今后河西人口还将更加“稠密”，影响的人群可能更多。
因此，《规划》提出了部分解决措施：产生电磁辐射的设备例如110千伏变电站、高压走廊半径50米范围内不得建设居民住宅，并尽快拆除、搬迁现有的辐射源。对于该区境内的广播电视塔（江东门附近）的辐射污染问题，《规划》提出：要针对这一问题，开展解决辐射污染问题的调查和研究，建议进行搬迁。光污染200米内禁建住宅
《规划》预见到：河西新城中央商务区10多幢标志性建筑大量采用了玻璃幕墙，将产生严重的光污染。为此，该环保规划明确提出：除控制新建建筑的玻璃幕墙面积外，已批准的玻璃幕墙建筑，在产生光污染的200米范围内不得建设住宅。
另外，对于空气中扬尘，《规划》认为会随着建设的进度逐渐减少，从2010年以后开始、到2020年要有明显改善；《规划》还列出了秦淮河、南河、莫愁湖等11项整治工程，提出要从2004年起，以2010年、2020年为节点，每到一节点将水质提高一度；河西新城的建设目标是在南京率先建成新型生态城区。通讯员钱年华快报记者孙洁
