“敬畏自然”是对迄今为止人类与自然关系的反思。对此的批判大多出自一些科学主义者，他们几乎以一种傲慢的态度看待“非我族类”的环保主义思想，这一点是应当引起警觉的。
近几百年来，随着科技的发展和工业的进步，人类在对待自然的关系上过度自信，以为自己能够像驯服动物一样征服自然。科学主义思想就是在此大背景下产生的。在人与自然的关系问题上，一些人以为科学技术可以解决所有问题，因而以一种简单的决定论和独断论对待其他思想，排斥其他信仰。上世纪三十年代中国思想界关于“科学与玄学”之争，虽然最终以科学派大获全胜而结束，但其中透出的科学主义倾向，却是今人应当重新反思的。一些科学主义者几乎不反省其负面效果和需改进之处，甚至以居高临下的态度和科学主义的话语阻止多元化的讨论。
事实上，人类对于自然资源的过度开采和利用带来了一系列消极后果，如生态圈环境不断恶化，农药等过度使用，导致发病率增高；汽车使人行动便捷，但造成大量的空气污染；二氧化碳排放量猛增导致地球臭氧层破坏，促成“温室效应”，非洲沿海和孟加拉国低地的大片土地被海水淹没，数以百万计的人们无家可归；利用水力发电所建立的大量水坝导致生态破坏，自然气候异常，无数原始森林被毁和自然物种濒临灭绝等。
反思这些现象，不是要求回到宇宙洪荒、茹毛饮血的时代，而是在承认科学技术的积极成果的同时，认真反思并改变其负面效应，以便更好地与自然为友，实现可持续的和谐发展。大海啸所带来的灾难，说明人类在预测和控制自然灾害方面都还有许多艰巨的任务要做。敬畏自然，就是把自然当作平等的伙伴，相敬如宾，而不是当作驯服的工具。人类可以利用自然、改造自然，但不必有征服自然和摧残自然的念头。
今天的生态哲学已经有了相当的发展，而许多科学主义者仍然用有限的自然观嘲笑生态主义者的世界观，这是我们应当警惕的。科学技术能够不断地给人类带来进步和福祉，但同时也应注意科学技术的某些负面效果，尤其是科学主义者的态度也需要与时俱进，警惕科学主义的傲慢与偏见败坏科学技术的名声。
