徽州山区盛产杉木，早在南宋时期徽人就已从事木材贸易了。他们每于冬季入山伐木，待至梅雨季节河水涨泛的时候，便利用水力运载出山，或由青弋江运至芜湖，或由新安江运至严州(今浙江建德县东北)，然后转销各地。明清时期，这种经营方式虽然继续进行，但由于苏浙地区经济的发展，徽州所产的木材已远远不能满足日益增长的需求了。于是习于经营木材贸易的徽人便远赴江西、湖广、四川开拓新的货源，扩大木材贩运活动。在这种活动中，以徽州婺源人最为活跃。他们以南京的上新河作为经营贸易的中心，利用长江水运之便，把上游的木材运集于此，然后分销苏浙或北方各地。
湘西沅江上游所产的辰杉，材质优良，销路极广。在这里办货的商人中以徽商资本最为雄厚。为了搜求良木，有些徽商还溯沅江而上，深入到贵州的深山老林之中。在沅江流进洞庭湖的入口处，有个德山镇，是湘西木材外运的必经之地。镇上徽商往来不绝，长年聚集在这里的徽州运夫就不下数千人。
四川建昌卫(治所在今西昌)所产抬山，剖成木板，花纹极为可爱，又有千年古木名曰“双连”，都是难得的畅销货。有许多商人雇募人夫入山采伐，将木材投入河中，沿金沙江漂流而下，进入长江之后，始扎成木，运往南京。在这里活动的商人中有不少就是徽人。明末歙人许朴“西涉夜郎、邛笋之境”，甚至在深山老林中迷失道路，“供销偻扳崖谷，行冰雪中”，为的就是寻求木材。他转运到芜湖的沙板，仅被人盗卖者已值银百两。歙人程之藩少时随其父入蜀经商，后来在建昌雅州宣慰司辖地伐木贩卖，役夫常达数百人。
杭州也是一个重要的木材集散地。清朝乾隆时，徽州木商在候潮门外创立木业公所，藉以维护徽州同行人的利益。他们在钱塘江畔用于停靠木筏堆放木材的场地达3600余亩。杭州的木材除来自徽州者外，还有不少来自浙西山区。衢州府的开化等县，民多种植杉木，杉木成材后，卖给徽商，由徽商募人采伐，运销于苏杭。徽州木商在北方各地也很活跃。明朝万历时，徽人王天俊等乘北京修建乾清、坤宁二宫之机，贿赂权贵，营求采办“皇木”16万株的证件，企图藉此规避关税钱五六万两。这个图谋虽未实现，但他们经营规模之大已可窥一斑了。
