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自主创新需要有大手笔投入，也需要精打细算，盘活现有科研资源。科研基础和经济实力都较弱的西部地区，更应注重提高科技资源配置的效率，走一条节约型的自主创新之路。
要提高配置效率，就要全面整合科技资源，改变科研领域因为条块分割等原因造成低水平重复建设的现象。一个科研建设项目的设计和设备再先进，如果利用率很低，仍然可以说这是“低水平”。因为它没有发挥多大的作用，跟一个落后的项目、落后的设备，没什 么两样。利用率低下，也会导致重复建设，形成恶性循环。
全面整合科技资源，需要寻求体制和机制上的突破。政府应通过系统配套的政策措施，起主导和引导的作用。2004年，重庆在全国率先提出建设“三大科技平台”的构想。经过一段时间努力，初步形成了以军地科技资源共享核心，以重点实验室、工程技术研究中心等为主体的研究开发平台体系;以大型科学仪器设备、自然科技资源共享为核心的资源共享平台体系;以重庆高交会暨军转民博览会、生产力促进中心等为依托的成果转化平台体系。资源共享平台启用后，全市企事业单位和科研院所总价值近10亿元的大型科学仪器设备的利用率，当年便由原来的30%提高到了70%。可见，提高利用率有时比增加直接投入还管用。
三大科技平台促进了区域内科技资源的合理配置和开放共享，弥补了公共科技平台资源的不足和分布的不合理，在一定程度上改善了科研基础条件，促进了创新和创业。2004年，重庆每100万元研发经费支出产生的专利和论文数之和居全国第一位，企业新产品销售收入占产品销售收入的比重在全国列第二位。
搞自主创新，无疑需要大幅增加投入。但重庆的实践证明，通过体制和机制创新，提高科研资源的配置效率，是一条更适合西部地区的节约型创新之路。它还能通过科研平台的集中攻关，培育形成创新团队，在较短的时间内实现重点突破。以重点突破带动整体创新能力的提高，也是科研基础相对薄弱的西部地区，现阶段应该予以重点规划的。
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