首先是要注意搞好人事分配制度的改革：实行职员制、聘任制和本校工资制。推进后勤社会化，积极引入社会力量办后勤。加快改制后勤业务单位。建立精干的后勤监督机关。负责检查托管质量和服务质量。
其次是要注意深化教学改革。要确立本科教育教学理念和人才培养目标。适应本科教育大众化，坚持“有教无类、因材施教、厚积薄发、经世致用”，以素质教育为基础，以
专业教育为主干，培养素质好、基础好、动手快、转型快的事业骨干。要确立研究生教育教学理念和人才培养目标。适应研究生教育扩大规模的趋势，坚持以学术为根基，以研究为主旨，以创新为导向，培养应用为主的创新性研究型人才。
深圳大学将全面推进本科素质教育。坚持办学以学生为本，育人以素质为本，素质以做人为本，积极探索大学素质教育体系。通过确定素质教育的五项指标（优良的品行，高雅的审美，健康的心理，良好的体质，现代人的基本技能），设计素质教育课程组合，设置素质教育实践学分，开展素质教育测试（普通话、英语口语、信息技术应用能力、心理咨询、体质健康），建立校外素质教育培养基地，结合学生思想政治教育、校园社团活动和校园文化建设，锻炼品行、扶持兴趣。把素质教育融入教学计划，融入校园生活，融入学生在校学习全过程。
为了实现深圳大学建设教学研究型大学的发展目标，深大今后将注意加强科学研究，确立纵横结合、重在应用的科技研究战略。明确组大团队、拿大项目、创大成果、取大影响的科研主攻方向，积极参与国家科研计划。扶持横向科研，支持设立与企业合作的研发中心，建设面向产业的公共技术平台和信息资料平台。
要加强与港澳台地区高校的交流与合作。深大早在2002年就实行了港澳台地区生源按大陆生源收费标准收费。今后，将进一步采用师生互派、学分互认、合作科研、联办会议、交流资料、合办教育机构等方式，取得实质性的交流效果与合作成果，加大在港澳台的招生数量。
