整改提高阶段是集中时间、集中精力解决问题的关键阶段，也是根据民主评议情况着手进行教育转化和组织处理有关党员的重要环节。村级党组织和广大农村党员处在“三农”工作第一线，面对的情况更为复杂，矛盾更为集中，必须更加注重把握政策，确保第三批先进性教育活动不走过场，不出偏差。
要认真贯彻落实党在农村各项方针政策，把广大农村党员的注意力和积极性，及时
引导到建设社会主义新农村上来。要积极引导广大农村党员认真学习胡锦涛总书记等中央领导同志关于建设社会主义新农村的一系列指示精神和中央有关部署要求，学习党在新时期的“三农”政策，开展好党章“五个一”专题教育。通过学习教育，不断提高广大党员贯彻落实“三个代表”重要思想和科学发展观的能力和水平，把教育活动中激发出来的政治热情和进取精神转化为建设社会主义新农村的实际行动。
要坚持正面教育、自我教育为主的原则。要把统一思想、提高认识的工作贯穿教育活动始终，引导农村党员抓住机遇，勇于查找和努力解决自身同新形势新任务不适应、不符合的问题，特别是思想、组织、作风和工作等方面存在的突出问题。同时，要多做理顺情绪、化解矛盾的工作，多做凝聚人心、鼓舞士气的工作，多做密切党群干群关系、维护安定团结的工作。要鼓励和支持农村党员干部解放思想、干事创业，保护好他们的工作积极性、创造性，增强党员自我提高、自我完善的内动力。对那些不履行党员义务、不符合党员条件的党员，要多做耐心细致的思想政治工作，使他们尽快转化；对经教育不改、不符合党员条件的，要根据党章和有关规定按正常程序进行处理；对违纪党员，要按照有关规定给予纪律处分。
要坚持自我教育为主与开门搞教育相结合。农村党组织和农村党员，直接面对群众、服务群众，群众对教育活动的要求更直接、更具体、更迫切。各级必须自觉而坚定地贯彻好正面教育、自我教育为主的方针，同时要坚持走群众路线。要广泛征求群众意见，依靠群众的帮助查摆问题；要真心实意地为群众办好事、办实事，及时发现和妥善处理带有苗头性、倾向性的问题，对涉及社会治安、征地拆迁、民主选举、宗族、宗教等方面的问题要依法、依政策处理，用实实在在的效果让农民群众切实看到先进性教育活动带来的变化。
要处理好对农村党员严格要求与关心爱护的关系。对生活比较困难的党员，基层党组织既要严格教育、严格管理、严格监督，又要真正重视、真情关怀、真心爱护，多理解、多支持、多解决一些困难、多办一些实事，增强农村党员的归属感、认同感，使他们在先进性教育活动中真正受到教育，真学、真议、真改，真正得到提高。
