越来越多的排行榜已引起一些高校的反感，在最近出版的《中国科大报》上，中国科学院院士、中国科技大学校长朱清时专门写了“致青少年学子的一封信”，提醒即将参加高考的年轻学子们，在选择学校时，不要盲目浮躁随大流，“尤其不要被市场化运作的所谓大学排名榜所诱导。”
陕西省教育厅社会力量办学管理中心副主任李维民认为，要真正给大学排名，有好
多问题需要解决，比如评价机构的资质问题以及评价方法是否科学，“虽然教育部明确规定不允许民间机构给民办高校排名，但因为法律没这方面的规定，即使有人这样做，我们也没有一点办法去取缔或者制裁它。”李维民认为，现在好多排名数据都由学校自己报，“肯定有夸大的嫌疑。”
另有教育方面的人士撰文指出，如何去监督大学排行中的评价程序也是目前存在的一个大问题，“排名的广告效应对于那些非名校来说极具价值。而只要有广告效应存在，就应该警惕排行榜中因利益诉求而导致的暗箱操作。”
不赞成对大学进行排名的李维民还认为，排名会产生一些负面影响，“竞争是必要的，但是要良性的，把别人踩在脚下这是什么竞争，违背了教育的宗旨，共同发展，这才叫好。”
中国人民大学教授顾海兵甚至认为，2010年之前，不具备大学排名的内外条件。他指出，大学的排名必须以成熟的市场经济体制、稳定的制度为前提，必须有公认的公正排名机构。目前市场经济体制还未成熟，大学与政府的关系、大学之间的关系没有定型或趋于正常，大学仍有行政级别，公正、公平的竞争环境没有形成，显然不具备大学排名基础。
