第二次全国经济普查涉及除农业以外的19个国民经济门类、90个行业大类、378个行业中类和875个行业小类，涉及普查对象约有800万个各类单位和3000多万个个体经营户，可谓范围广、参与部门多、普查技术要求高、工作难度大。因此，在组织实施上要求各地区、各部门要按照“全国统一领导、部门分工协作、地方分级负责、各方共同参与”的原则，认真做好此项重大国情国力普查的宣传动员和组织实施工作。国务院将成立第二次全国经济普查领导小组，负责普查的组织和实施。普查领导小组由国务院领导同志任组长，成员单位包括国务院办公厅、国家统计局、发展改革委、中央宣传部、中央编办、监察部、民政部、财政部、税务总局、工商总局和质检总局等部门。