2003年抗击非典战斗中，钟南山用实事求是的科学精神向世人诠释了一个共产党员的先进性。当有关权威机构传来消息，在广东送去的两例死亡病例肺组织标本切片中，发现了典型衣原体，并建议对同类病例使用抗生素进行治疗时，钟南山没有在权威面前迷失方向。他不同意典型衣原体是非典型肺炎病因的观点，认为典型的衣原体可能是致死的原因之一，但不可能是致病的原因。在这种科学精神的指引下，钟南山和他的研究团队日夜攻关，终于在短时间内摸索出了一套行之有效的救治办法，即“三早三合理”（早诊断、早隔离、早治疗和合理使用皮质激素、合理使用呼吸机、合理治疗并发症），为广东实现非典死亡率最低、治愈率最高作出了贡献。

　　近年来，钟南山先后当选全国政协委员和全国人大代表，是全国两会的“明星代表”之一。然而，他并不仅仅将自己局限在医学领域——相反，在他身上，人们可以找寻到知识分子以天下为己任的慷慨风骨和任事精神，他对社会弊端的抨击、对社会价值的倡导每每引发全社会的高度关注。据新华社