他长期从事湖泊演变、湿地环境生态与灾害监测等方面的研究工作，先后主持和参加国家自然科学基金、973、863等25个项目的研究工作。近年来，先后发表学术论文80多篇，专著4部，有8项发明或实用新型专利，获得湖北省自然科学二等奖、科技进步二等奖等多项奖励。2009年荣获中科院院地合作科技类先进个人一等奖。

　　杜耘充分发挥自身专业特长，为湖北生态建设和环境保护做出了贡献。通过政协常委会、双月座谈会等有关会议，向省领导做过科技体制改革、饮用水安全、土地利用调查与问题、矿产资源开发与利用等专题汇报；先后提交了关于平原湖区湿地水环境保护、湿地保护立法、农村水环境治理、三峡工程对湖北省的影响、南水北调中线工程对汉江中下游的影响等多份提案。目前，湖泊湿地保护立法已列入省人大议事日程，有关三峡工程的影响已进入后三峡规划有关内容，信息“重视三峡工程建设对长江中游平原湖区生态环境的影响”被全国政协采用，调查报告“加强应对全球气候变化，促进湖北省可持续发展”受到省委省政府高度重视。