面对如潮的批评，《自然》杂志主编蒂姆·阿彭策勒和总编辑菲利普·坎贝尔8月6日共同署名，在网站原文下方发布了道歉声明，称：“我们注意到相关讨论中指出的一些错误，以及相关统计中缺乏更多的细节(我们现在回头看对此表示遗憾)，造成了我们支持指责叶诗文的印象，而需要强调的是这不是我们的意图。”该网站还对原文的副标题进行了修改，并对文中的一些错误进行了改正。

　　此前发起公开抗议的学者王立铭在《自然》公开道歉后表示：“西方人对中国人常有两个偏见，一是我们能力差做不到，二是做到了就是靠欺骗。因此像这次关于叶诗文的争议，我们就应该从事实出发，据理力争。”