经过八个月的辛勤努力，中国科学家在防治SARS基础理论研究中取得重大突破。美国最新出版的国际权威杂志《科学》，全文公布了中国课题组研究SARS的分子流行病学及解析SARS冠状病毒分子进化规律的最新成果（www.sciencexpress.org）。这是我国科学家在SARS研究中所获得的又一项具有重大意义的科研成果，为世界各国防治SARS提供了新的科学依据。研究成果在《科学》杂志的发表，表明已得到了国际科技界的权威认可和高度重视。
    课题组通过对SARS流行病学深入的调查研究，认识到SARS流行早期具有独立发生，有限地域，有限传播的特征，这一特性不仅提示SARS冠状病毒的自然来源，而且与2003年春节开始的超级传播事件后的传染性有很大的不同。据此，课题组将2002/2003期间的SARS流行划分为早、中、晚三期进行分析。在研究过程中，课题组完成了来自广东和香港的SARS发展各阶段的24个病人的18株SARS冠状病毒及11份含病毒生物样品的病毒基因组全序列测定，结合已经公开的其他32条人类SARS冠状病毒及2条果子狸的SARS样冠状病毒的基因组全序列进行生物信息学分析，对 SARS冠状病毒在流行过程中的分子变异规律有了更深刻的认识。SARS冠状病毒的分子进化不仅印证了流行病学调查所得到的结论，而且为分离自动物和不同流行阶段的SARS冠状病毒提供了特征基因型的分子标记。课题组通过进化模型的计算获得了一系列关键的基础数据，发现SARS冠状病毒基因组的中性突变速度为艾滋病毒基因组的突变速度的三分之一。认识到SARS冠状病毒基因组各主要片段，在SARS流行过程中，对于环境的选择压力有不同的反应。研究发现，在来自于动物的病毒感染人类初期，致病能力和传播力似乎较弱，疾病相对易于控制和治疗；但由于受到强大的正选择压力，病毒变异快。经过一段时间在人体上的适应，SARS流行进入中后期后，病毒在负选择压力下，变异趋缓，但传播能力却有提高，病情一般较为严重。2003/2004阶段的SARS病例可以说是重现了早期事件，印证了研究的结果。今后，如果注意对可能来自动物的新发SARS冠状病毒感染的监测，及时加以隔离、控制，当不至于产生类似于2003年初的爆发流行。这一研究所提供的思路和方法对于今后深入研究SARS冠状病毒的动物来源及其传播和变异规律，也具有重要的参考价值。
    在全国防治非典科技攻关组的领导和支持下，SARS分子流行病学研究协作组聚集了来自广东、上海、北京、武汉、香港 以及美国芝加哥大学等15个研究机构的60多名科技人员，精诚合作，完成了此次较为庞大的科研攻关任务。此次科研攻关获得了国家高科技发展计划（863计划），国家重点基础研究计划（973计划），广东省SARS科技攻关计划以及上海、香港和其他各方面的支持和资助。中国科学家在防治SARS基础理论研究中取得重大突破，表明了中国科技工作者，在党和政府的正确领导下，面对新生传染病的突然挑战，是有智慧形成自己创新的研究思路，有决心组织协力同心的研究团体，有勇气面对危险和困难的挑战，有能力开展高水平、高质量的科学研究的。这项研究工作的完成，必将提高我国科学工作者的信心，进一步做好工作，为我国人民和世界人民的健康幸福，做出更多的贡献。