近年来，西藏各级卫生部门在自治区党委、政府的正确领导下，大力加强卫生基础设施建设和队伍建设，始终坚持以预防为主的方针，推动卫生工作的重点向预防保健方面战略转移，重点疾病预防控制工作成绩喜人。
传染病防治方面，儿童“四苗”计划免疫接种率连续8年以乡为单位达到85％，连续9年无脊髓灰质炎病例报告，麻疹、结核、百日咳等疾病得到了有效控制。同时加大了对性病
、艾滋病的监测和防治力度。通过积极有效的防治工作，全区传染病总发病率已由1990年的910．84／10万，下降到2003 年的373．25／10万。2003年，在区党委、政府的坚强领导下，广大医务人员艰苦奋战，与全区各有关部门团结协作，实现了区党委提出的“拒非典于区门之外”的阶段性目标。
地方病防治方面，重点加强了鼠疫、碘缺乏病和大骨节病的防治工作。加大鼠疫防治基础设施建设力度，特别是高度重视青藏铁路沿线的鼠疫疫情监测和防治工作，开展规模空前的灭獭行动，确保青藏铁路建设安全。确定以食盐加碘为主的综合防治措施，对全区137万特需人群投服碘油丸，碘盐覆盖率逐年提高。制定《西藏自治区大骨节病防治工作规划》，投资200万元实施大骨节病防治试点项目，通过采取搬迁、换粮、补硒等综合措施，部分病区患者的病情已显著改善。
