藤森说，自从他2000年11月离开秘鲁以来，一批曾跟他一起工作过的部长、议员以及其他政府官员遭到了“政 治仇恨和报复”，他对此感到遗憾和无奈。他表示，他决定返回秘鲁，主要是为了参加2006年的总统竞选，以便能继续“ 为秘鲁人民效劳”，共同寻找“洞口外的亮光”。

　　藤森说，他在日本东京宣布辞去总统职务是不得已而为之的事，事先并无这样的打算，相信秘鲁人民将来一定能对他 在非常复杂的环境下作出的这一决定予以理解和支持。他还说，秘鲁司法部门针对他的指控纯粹是政治诬陷和迫害。

　　藤森已受到秘鲁司法部门的多项指控，其中包括：擅自离弃总统职位，非法使用国家钱财为蒙特西诺斯支付“补偿金 ”，用政府基金收买国会议员，暗中操纵准军事组织屠杀无辜平民。秘鲁司法部门已下达了3次针对藤森的国际逮捕令，要求 国际刑警组织协助将滞留在日本的藤森捉拿归案。

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