韩国外交部与总统府之间在一系列的重要问题上存在着明显的分歧，而且相互之间都不愿作出让步，以致韩国的外交政策屡屡产生被动。
美韩问题：政治人士认为，外交部一些官员公开批评总统卢武铉的对美政策。自从上台以来，卢武铉政府在对美国的问题上出现了与以往历届政府完全不一样的做法。作为韩国历史上最左倾的一届政府，卢武铉政府公开批评美国，导致韩国与华盛顿的关系十分紧张。而在外交部，包括外长在内的高级官员则主张维持与美国的特殊关系。此外，双方在这一问题上的分岐还涉及了重新部署美国驻韩国军事基地和韩国派兵前往伊拉克等问题。
韩朝问题：卢武铉和他的顾问班子主张以独立自主的政治与外交理念来解决朝鲜核问题，而不是一味顺从美国。同时，青瓦台方面还将朝鲜核危机的磋商谈判解决与韩国向伊拉克出兵相挂钩，即以同意向伊拉克出兵的方式来换取美国在这方面可能作出的让步，并反对美国孤立朝鲜。而在韩国外交部内，官员们则认为，应该借助于美国的压力来解决朝鲜核危机，包括孤立和封锁。
韩日问题：由于日本也在六方会谈中占有一席之地，因此在六方会谈即将举行之前，韩国方面显然不愿意搞僵了与日本的关系。但在韩国外交部，情况却恰恰相反。在关乎主权问题的独岛问题上，韩国外交部表现出了强硬的态度。这是因为韩国邮政部门决定于16日发行一套以独岛为主题的纪念邮票，此举遭到了日本外务省的抗议。然而，在韩国最高层都留有余地的时候，惟独韩国外交部却绝不让步，拒绝日方的抗议，搞僵了韩日之间的关系，从而在六方会谈中陷入了另一种被动。 今凌
|
