争论焦点一：是弃核还是冻结
2003年10月8日，朝鲜外务省发言人曾一度表示朝鲜以“半岛无核化为终极目标”。但后来，朝鲜的主张是，在满足其条件后，它可以“停止”或“冻结”核计划，而不是弃除。
美国认为，“冻结”是可以的，但它必须是弃除核计划的第一步，否则就没有意义。
争论焦点二：如何补偿
在第一轮六方会谈时，朝鲜曾提出一个以“冻结”为内容的补偿方案。美国认为，朝鲜没有表示完全放弃核计划前，在“冻结”阶段不提供任何“补偿”，但它不反对其他国家向朝鲜提供这类“补偿”。
争论焦点三：关于安全保证
朝鲜主张，朝核问题是因美国将之定为“邪恶轴心”和核打击目标引起的，朝鲜发展核武器是为了自卫。因此，朝鲜停止其核计划的前提是美国必须提供安全保证。方式是朝美间签订互不侵犯条约。
美国主张朝核问题是因朝鲜违背《核框架协议》秘密恢复核计划引起，只有朝鲜放弃其核计划才能谈及其他。美国可以表明它无意入侵朝鲜，甚至可以有一个文字材料，但绝不同朝鲜签署任何双边文件。至于安全保证，也要分阶段承诺。
争论焦点四：关于浓缩铀计划
美国认定，朝鲜除了对废核燃料棒进行再处理以获取钚制造核武器外，还有通过浓缩铀制造核武器的计划。美国主张，要想真正解决朝核问题，朝鲜就必须承认和公开其浓缩铀计划，并将之纳入弃核管理之下。
朝鲜先是含混承认，后坚决否认有浓缩铀计划。由此可以预料，这个问题将成为今后美朝争执的焦点。如果在这个问题上不取得突破，朝核问题就会永陷僵局。
