然而，自从人们开始享受“谷歌流感趋势”带来的福祉后，也不禁开始担忧起自己的隐私问题。尽管谷歌高级法律顾问迈克.杨坚持在12 月9 日发表申明表示，“流感趋势”不包含任何个人身份信息。他说：“‘流感趋势’使用的数据是从几亿个搜索结果中聚合而来。这些数据不包含任何能够确定用户身份的信息。我们也从未透露过究竟有多少用户搜索过特定的关键词。”但相关隐私团体仍质疑表示，谷歌在利用搜索结果预测流感爆发的方法上缺乏透明性，目前还没有一个独立的机构来审核谷歌究竟是如何将用户的搜索结果转换成“流感趋势”服务的。

　　“我们其实是想知道，谷歌能否找到一种方法来确保他们的聚合数据不会泄露究竟是哪些用户提交了这些搜索信息，他们的这一技术应当更加透明。”电子隐私信息中心主席马克.罗登伯格说。他认为，这一问题非常重要，因为谷歌用于追踪流感爆发的技术同样可以用来追踪“非典”等其他疾病。他说：“假如底特律爆发了‘非典’，而当局又希望知道究竟是谁提交了相关的搜索结果，那么谷歌如何保证这些信息不被泄露？”

　　罗登伯格还指出，根据谷歌的隐私政策，与搜索结果相关的IP 地址都会在9 个月后被删除，但与此相悖的是，当谷歌推出“流感趋势”时，他们却表示，这一服务不仅会利用当前的搜索结果，还会对之前的数据进行分析，最早甚至可以追溯到2003 年。

　　美国网络民权组织“数字民主中心”的执行总监杰弗里.切斯特则指出，谷歌发布“流感趋势”实际上是向医药市场表明，谷歌有能力通过其搜索结果提供复杂而精确的分析，从而帮助医药厂商发布更为精准的广告。“谷歌已经意识到，原本毫无用处的搜索数据可以为谷歌创造新的利润来源。向其数量庞大的用户投放健康领域的定位广告将非常有利可图。”

　　计算机程序设计师、电子前线基金会先锋奖获得者西塞.凡克尔斯廷近日在《卫报》上发表评论文章说，如今还没有一种有效的解决方案把“谷歌流感趋势”从“两难境地”中解救出来，因为这一技术是福是祸主要还得依赖人们如何使用它。但西塞同时提醒人们，对于疾病监测系统一定要抱以“小心翼翼”的态度。