现在的最高领袖哈梅内伊是穆萨维长期的政治对手，两伊战争期间，时任总理穆萨维与时任总统哈梅内伊常常发生冲突。

　　他们的矛盾主要集中在经济领域：穆萨维主张采取国家强化控制的战时经济政策，哈梅内伊则反对制定很多限制性规章。

　　那时的哈梅内伊在一些问题上比穆萨维更温和，并因此经常受到时任最高领袖鲁霍拉·霍梅尼的批评。而穆萨维则是霍梅尼强硬政治路线的支持者。

　　尽管其长期政治对手哈梅内伊现在掌握着最高权力，但“圈内人”的身份依然保证穆萨维有能力一次次向伊朗的重要职位发起冲击。此外，分析家认为，不少反对派群众已把矛头由内贾德转至哈梅内伊身上，指他才是“真正敌人”。