布什发展NMD计划首先面临的是来自技术方面的挑战，即NMD的可行性。

　　虽然有些战略专家拼命鼓吹NMD计划的可行性，甚至辩解说一种类似NMD计划的小型导弹防御系统——宙斯盾系统已经在美国海军得到了运用且收效良好。但有些人对此说法嗤之以鼻，他们认为用导弹来防御数千平方公里的领土和海空与防御一个航母编队显然无法相提并论，其技术难度和复杂性也是不可比较的。

　　布什面临的第二项强大挑战来自俄罗斯，部署NMD计划可能使美俄关系重新紧张。另外也面临来自中国的强烈反对。这将有可能挑起新一轮的核军备竞赛。