2002年11月16日中国广东佛山发现第一起后来可称为SARS的病例。2003年2月3日至14日广东发病进入高峰，但病原不清，而且有家族及医护人员极易被集体传染的特点。2月18日中国疾病研究中心宣布，广东严重呼吸道综合征的病原基本可以确定为衣原体。同日在广东卫生厅召开的紧急会议上，广州大医院专家一致认为，不能简单认定衣原体就是唯一病原。
3月25日广东省中医院护士长叶欣殉职，是抗非典战斗中第一位被患者传染而牺牲的医
护人员。3月中旬至4月1日网上流传的“北京疫情”部分在现实中得到证实，政府对于非典型肺炎的认识和应对措施经历着艰难而痛苦的转变。4月16日世界卫生组织在日内瓦宣布，病毒已经找到，正式命名为SARS病毒。4月20日这一天，应该写进历史，标志性的事情包括：A.北京非典确诊病人和疑似病例，较之前一天成倍增加。B.党中央、国务院明确提出要以对人民高度负责的态度，及时发现、报告和公布疫情，决不允许缓报、漏报和瞒报。卫生部决定，原来五天公布一次疫情，改为每天公布。C.非典被列入我国法定传染病。D.由于防治非典不力，卫生部长张文康、北京市委副书记孟学农被免职。4月21日冲锋在抗击非典最前线而被传染的中山大学附属第三医院传染病科党支部书记邓练贤不幸逝世。4月22日中国公布非典元凶冠状病毒图。4月23日北京市4000多名施工人员进驻小汤山医院施工现场。一周后,工程通过验收交付使用。
4月24日，中央军委下达紧急支援北京组建小汤山非典定点医院的命令。当晚，从全军13个大单位114所医院抽调的医护人员开始集结。4月26日国务院副总理吴仪兼任卫生部长。
5月1日经过8天的紧急筹建，北京市第一家专门治疗非典的临时性传染病医院小汤山医院二部开始接收病人。此时军队支援北京医护人员1200余人陆续到位。5月7日卫生部表示，鉴于目前国际上对SARS病原体的最后确认还没有形成共识，我国暂时将SARS归入乙类传染病的特殊传染病。5月9日北京宣布，医务人员的感染比例已经呈明显下降趋势。从4月21日到5月1日，每天平均是15.81人。从5月2日开始到5月8日，平均每天6.3人。5月11日北京疫情大幅下降已有两天。有人担忧，山西、内蒙古等地疫情有向农村蔓延的趋势。5月14日实验人员从6只果子狸标本中分离到3株非典样病毒，从1只貉标本中分离到1株非典样病毒。科研人员通过电镜对病毒形态进行分析，确定是冠状病毒。5月19日国家批准第一个治疗非典新药用于临床研究。5月25日研究发现非典病毒来自野生动物，与家畜宠物无关。5月29日科学家揭示非典传播三特点潜伏期病人无传染性。5月29日病毒不具有普遍性“果子狸传染非典”还没定论。5月30日内地诞生首块检测非典病毒抗体的蛋白质芯片。6月3日我国非典疫苗研制取得突破实验鼠体内测出抗体。6月8日北京首次实现新增非典病例为零防非又上新台阶。6月10日外交部：限制中国往访团组和人员的国家已有127个。6月10日北京连续三天实现“五零”纪录加强三方面工作。6月14日河北、内蒙古、山西、天津解除旅游警告。6月15日中国内地实现三零北京又出院21例。6月20日小汤山医院最后18名患者出院。在不到两个月的时间里，这座全国最大的非典定点收治医院完成了从组建、运转到关闭的全过程，共有672名非典病人在这里获得新生，治愈率超过98．8%。6月20日中华人民共和国中央军事委员会发布通令，嘉奖在抗击非典斗争中建立突出功绩的小汤山医院全体官兵。6月23日世界卫生组织在日内瓦宣布，中国香港特别行政区已被排除在爆发非典型肺炎疫情地区的名单之外。6月24日当地夏令时9时（北京时间15时）世界卫生组织在日内瓦宣布，北京的非典型肺炎疫情明显缓和，已符合世界卫生组织有关标准，因此解除对北京的旅行警告，同时将北京从非典疫区名单中排除。
