环球时报驻台北特约撰稿人林镜报道，达赖已经离台半个月，衍生的政治效应还是不断发酵，日前台“监察院”收到民众检举，指邀达赖赴台的7县市在经费运用上，有独厚特定宗教的情形。“内政部”随即发函要这些县市就达赖赴台的经费运用说明清楚。绿营人士宣称台当局此举是“秋后算帐”。

　　据台湾东森新闻报道，“内政部”9月15日发函给高雄市等南部7县市，以邀请达赖赴台祈福违背有关规定的“政教分离”原则，并涉嫌以“政府”经费支付特定宗教人士赴台的费用，要求他们说清楚达赖赴台祈福的经费预算。

　　高雄市政府、台南县与高雄县均声称，达赖赴台没有花“‘公务’预算一毛钱”，赴台的所有费用，都是由达赖喇嘛西藏宗教基金会支付。民进党“立委”田秋堇则宣称，“监察院”大动作彻查达赖赴台的花费，根本是“秋后算帐”，对达赖“非常失礼”。

　　“内政部监察委员”程仁宏对此解释，书面回复是正常程序，是为了要了解案情，并强调，调查没有蓝绿之分。“内政部民政司副司长”林清淇也说，南部县市的回函都已经明确表示无独厚特定宗教的情况。“内政部”对这件事没有加什么意见在里面，也没有“秋后算帐”的意思，外界不需多做联想。