根据深圳市级党政机构改革方案，党委机构方面，保留纪律检查委员会机关、办公厅、组织部、宣传部（加挂精神文明建设委员会办公室牌子）、统一战线工作部、政法委员会（市维护稳定及社会综合治理委员会办公室与其合署办公）、政策研究室、直属机关工作委员会。驻深单位工作委员会单独设置。保密委员会办公室（市国家保密局）并入办公厅，对外挂牌。老干部管理职能仍由组织部承担。不再保留口岸工作委员会，其职能划入驻深单位工作委员会。机构编制委员会办公室为市机构编制委员会负责全市行政体制、机构改革和机构编制管理的常设办事机构，既是市委的工作机构，又是市政府的工作机构，与市人事局合署办公，业务直接对市机构编制委员会负责。

　　市政府机构方面，综合与经济管理部门保留财政局、水务局、国有资产管理办公室、经济体制改革办公室。计划局更名为发展计划局。农业局更名为农林渔业局，不再保留海洋与水产局牌子。旅游管理局更名为旅游局，单独设置，负责旅游资源的规划、管理和开发利用，培育发展旅游市场，加强旅游行业管理。不再保留经济发展局、贸易发展局、外商投资局、经济协作办公室，组建经济贸易局、对外贸易经济合作局。经济贸易局负责工业、商业的行业管理和安全生产监督管理与职业安全监察，以及有关横向经济技术协作与管理；对外贸易经济合作局负责对外贸易经济合作和对外招商引资工作。不再保留运输局、港务管理局，组建交通局，加挂港务管理局牌子。组建信息化办公室，原运输局、统计信息局有关通讯、信息和网络协调管理以及有线电视台的网络规划等职能，统一划归信息化办公室。执法监管部门保留环境保护局、工商行政管理局（加挂物价局牌子）、质量技术监督局、药品监督管理局。社会管理部门和政务部门保留政府办公厅、教育局、科学技术局（加挂知识产权局牌子）、公安局、监察局、民政局、司法局、人事局、劳动局、建设局、文化局（加挂广播电影电视局、新闻出版局、版权局牌子）、卫生局、计划生育办公室、审计局、口岸办公室、法制局、外事办公室（加挂港澳事务办公室牌子）、侨务办公室。规划国土局（地质矿产局）更名为规划与国土资源局，负责城市规划与土地、矿产及海洋等资源和房地产权以及房地产市场管理，原农业局承担的海洋资源管理职能划归规划与国土资源局。统计信息局更名为统计局。城市管理办公室加挂城市管理行政执法局牌子，增加城市管理行政执法的统一领导、综合协调职能。市委、市政府信访办公室并入政府办公厅。住宅局调整为市政府直属事业单位，根据市政府授权，负责全市住房政策与房改政策的制定、物业管理和安居房的规划、建设、分配与租售管理。此外，保留社会保险管理局，仍为市政府直属事业单位，民政局承担的农村养老保险管理职能划入该局。保留档案局，与档案馆实行局馆合一，赋予档案行政管理职能，为政府办公厅管理的副局级事业单位。机关事务管理局仍为市政府直属事业单位，根据市政府授权，承担机关事务管理职能。体育发展中心（加挂体育总会牌子）更名为体育局（加挂体育总会牌子），赋予体育行政管理职能，为市政府直属事业单位。保留公路局，为交通局管理的副局级事业单位。民防委员会加挂地震局牌子，升格为副局级，仍为建设局管理的事业单位。气象局（台）调整为市政府直属事业单位，升格为副局级，仍实行局台合一。保留高新技术产业园领导小组办公室、龙岗大工业区（深圳出口加工区）管委会。不再保留福田保税区管理局、沙头角保税区管理局、盐田保税区管理，组建保税区管理局，统一管理3个保税区的工作。人大常委会机关、政协机关、群众团体机关根据有关法律、章程设置机构，参照省的改革办法进行改革。

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