自赵建铭涉案、收押、交保，台大医院出现了不少自责、自省的声音。外科加护病房主任柯文哲于媒体投书指出，台大不应该“在权势之前矮了身子”；对于赵建铭升任主治医师、享受专属特权等等传闻，柯主任认为台大医院要认错、道歉，才对得起该院百年的荣誉与传统。此外，医院院长林芳郁也发表对全院员工之公开信，表示其对赵建铭所涉诸多弊案与行为“深恶痛绝”。
台湾《中国时报》今日发表社论说，在五月中旬赵建铭传出涉入台开案以来，这大概是我们唯一听到来自相关机关的诚挚道歉。这样的空谷之音固然让社会大众体会到台大医院的反省，也感慨其他单位的麻木、迟顿与势利。我们在此要肯定台大致歉的诚意，并检视所有弊案涉案人员的反省与改过能力。
社论指出，在赵建铭所涉诸多案件中，卷入其中的其他公、私单位至少包括彰银、台开、“财政部”、台银、“国票”、证交所、检调、诚品、桌协等。这些单位的涉案人员是否有足够的司法证据证明有罪是一回事，但是他们究竟有没有“在权势之前矮了身子”，社会大众恐怕早有定见。他们有出来认错、道歉、反省吗？陈水扁先前曾经道过歉，但随后就埋怨求刑过重、羁押过当；这样算是诚心道歉吗？台大若干员工屈服于权贵，难道不是因为这些权贵的姿态太高了吗？整个社会所需要反省的，又岂仅是台大而已！
最后，我们在肯定台大反省态度之余，也希望该校能本诸其优良传统，以实际的作为做后续处理。依据台大网站所公布的人事法规，台大的考绩委员会应该要尽速集会，对赵建铭涉入台开案、收取药商回扣、旷席骨科部晨会、停职期间偕院外人员出入开刀房等行为，做讨论与处分建议。台开案固然属于“考绩法”“损害机关声誉之不检言行”，但对台大而言，收药商回扣与怠忽骨科部会议也同样严重。台大若能知耻近乎勇，在赵建铭弊案风暴中勉力维持“台湾最高学府”的格调，则在乌烟瘴气的政治气氛下，也算为台湾留下一丝清白的纪录。（本文略有删节）
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