南都讯 记者刘凡 通讯员梁淡丽 继寻找到德国疫情是10年前的病菌变种之后,昨日华大基因研究院又公布,已完成了检测大肠杆菌的试剂盒的研发,可将病菌的检测时间缩短至2-3小时,华大基因将该成果和检测方案向世界免费提供。
华大基因研究团队表示,通过整合之前发表的IonTorrent数据和基于Illum ina公司H iseq测序平台新产生的数据,并进行序列拼接,从而得到第一个真正意义上基于从头测序的组装结果。此次新发表的全基因组组装结果,比早前发布的版本更加完整(完整度> 99%),也修正了之前可能出现的组装错误。
通过基因序列分析,证实该大肠杆菌含有来自肠出血性大肠杆菌(EH EC)和肠黏附性大肠杆菌(EA EC)的致病基因。在这个研究结果基础上,华大基因军事医学科学院微生物流行病研究所的科研人员迅速开展了针对该大肠杆菌的诊断试剂盒的研发,并完成了疫情的治病病毒的检测诊断方案。这种大肠杆菌的检测试剂盒,可在收到样品后2-3小时内提供诊断结果。通过该试剂盒,可方便地对样品进行检测比对,从而确定该样品中是否含有治病的病毒,对疫情监控和和致病病菌的检测起着重要作用。
为了更好地控制此疫情的传播,华大基因表示,将免费为全球疾病控制和研究机构提供合成引物,为监控及预防全球范围内疫情的扩散提供帮助。华大基因还将最新的大肠杆菌组装序列信息和完整的大肠杆菌检测方法上传至网络,任何地方均可通过互联网链接( f t p:/ /ftp.genom ics.org.cn/pub/Ecoli_TY -2482/Es c he r i c hi a _ c o l i _ T Y -2482.contig.v2.fa.gz)下载。