8月20日,泰州市医药高新区一名西藏返泰人员新冠病毒核酸检测结果为阳性, 需要立即开展新冠病毒基因组测序、分型和溯源工作。泰州市疾控中心在上午9:30接到测序样本后,即刻安排运用华大智造“ADE自动化高通量测序产品组合”进行测序。
经过仅仅约13个小时,泰州市疾控中心在当晚10:30得出测序结果。通过与武汉野生株初步比对,证实其为奥密克戎BA.2.76变异株,与江苏省近期的西藏输入病例序列的比对结果显示也完全一致。
早在2021年,华大智造基因测序设备就已进驻泰州市疾病预防控制中心实验室,助力中心搭建起新冠溯源、细菌测序以及宏基因组测序能力。此次华大智造“ADE自动化高通量测序产品组合”的引入,将新冠溯源时间时间缩短至13小时左右,进一步提升了中心应急溯源能力,为当地紧急疫情下快速制定防疫政策提供科学依据。
华大智造“ADE自动化高通量测序产品组合”即DNBelab-D4数字化样本制备系统、DNBSEQ-E5测序仪和新冠溯源ATOPlex建库试剂组合三款产品的联合,助力基因测序全流程实现轻量化、简易化、多元化。值得一提的是,华大智造DNBelab-D4是国内首款基于数字微流控技术的自动化建库平台,大小30厘米见方,插电即可使用,开创性地实现“一卡建库,集成定量”;DNBSEQ-E5测序仪,最快3.5小时完成测序(SE100),小巧便携,可移动部署,能够即时响应特殊样本的紧急测序需求。测序完成10分钟内输出新冠病毒变异位点基因注释、变异支系鉴别、全长序列。
事实上,为了能够熟练掌握“ADE自动化高通量测序产品组合”的功能并充分发挥其优势, 泰州市疾病预防控制中心微生物检验科专门成立了测序工作小组,一直以实战化的方式开展相关标本的基因测序工作。泰州市疾控已为应对和处置突发疫情做好了必要的技术储备,从而顺利完成本次新冠病毒的测序溯源。在疫情防控新形势下,面对突发公共卫生事件和重大疾病防控,当务之急是建立起本地化 “一锤定音”病毒鉴定溯源能力与应急处置能力。华大智造ADE自动化高通量测序产品组合具备准确性高、快捷高效等特点,最快可在12小时*左右完成新冠病毒溯源分型,能够提高疾控中心等机构单位的病毒快速溯源能力。目前,ADE自动化高通量测序产品组合已在湖南益阳、广西北海、甘肃天水等多地一线海关、疾控等机构成功助力监测病毒变异的工作,满足不同样本规模的用户灵活选择。
*因操作熟练程度和样本量不同,实际完成时间可能会有差异。
(来源:新视线)