1999年4月15日，中纪委、监察部、海关总署接到举报信。

　　4月20日，中央领导作出重要批示，授命中纪委和海关总署负责查处。

　　6月11日，查处远华案方案组成立，敲定查处方案。

　　6月19日，由于内线通风报信，抓捕赖昌星行动失败。专案组撤回北京。赖昌星第一次出逃。

　　8月11日，根据截获的电话资料再次抓捕赖昌星，但因原福州公安局长庄如顺泄露消息行动再度失败。赖昌星再次出逃，在加拿大至今未归。

　　8月12日，专案组突审原福州公安局长庄如顺；

　　8月14日，专案组突审原厦门海关关长杨前线。

　　8月15日，庄、杨被押解进京。

　　8月23日，专案组在远华国际大厦售楼处抓获赖昌星老婆曾明娜的秘书陶咪等重要知情人。

　　9月17日，专案组在厦门召开海关全体人员大会，动员有问题的人投案自首。

　　2000年9月13日，福建漳州中级法院开庭审理原厦门市委副书记刘丰等第一批被告。

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