神舟六号航天员13日先后进行了开关舱门、穿脱压力服、穿舱、抽取冷凝水四大项“在轨干扰力”试验，结果表明航天员较大幅度动作对飞船姿态影响微小，飞船姿态保持良好，姿态控制发动机不需要启动。从此，航天员可自由进行类似幅度动作。
凌晨4时16分，飞船飞行第13圈，在地面指导下，结束了7小时8分钟休息的费俊龙，从轨道舱进入返回舱，将两舱之间的舱门关闭，六七分钟后重新打开。舱门在太空中关闭密
封和快速检漏得到验证，完全正常。
一个多小时后，航天员费俊龙在返回舱内，在规定时间进行了穿脱压力服试验。
14时25分，第20圈，在远望二号测控弧段内，费俊龙从坐椅上起身，拉着扶手、助力绳，头先脚后飘入轨道舱，随后以原来姿势飘回返回舱。聂海胜则从轨道舱到返回舱进行了两次类似动作。航天员在太空中穿舱时，就像鱼儿在水中轻轻游动。3次穿舱试验顺利完成。此前航天员因工作生活需要，曾两次十分缓慢地在两舱之间穿行，但这两次不算正式试验。
17时10分许，轨道舱内的航天员4分钟内连续按动抽取冷凝水开关约百次，地面人员监控了这一切。正常情况下根据舱内湿度变化情况，航天员每隔3小时抽取一次冷凝水。
四项试验取得了基本相同的结果，飞船只有微小摆动，姿态保持正常，姿态控制发动机不需要点火，“在轨干扰力”试验获得成功。飞船系统总体副主任设计师张书庭介绍，这标志着飞船能够承受航天员舱内活动的扰动，以后就不需要再安排类似试验。
试验结果让航天员敢于在太空中做一些幅度较大动作，记者从北京飞控中心大屏幕上看到，费俊龙在穿舱试验后，曾轻松地在返回舱的两个舷窗间较快地飘来飘去，拿着照相机以不同角度拍摄美丽的地球。他的这个动作在神舟五号飞行时是绝对禁止的。
费俊龙于凌晨4时16分结束了大约7小时8分钟的睡眠；13时05分，聂海胜结束7个多小时的睡眠，两位航天员休息后还分别进入轨道舱进行了其他科学实验。航天员和地面科技人员对各项实验获取的数据作了详细记录。
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