中国载人航天工程总设计师王永志在接受记者采访时表示：此次神舟六号上的两名航天员，要在太空中飞行多天，并首次进入轨道舱进行空间科学和技术实验，是第一次真正意义上的有人参与的空间科学实验，标志着中国载人航天工程开始进入了一个新发展阶段。
中国载人航天工程总设计王永志说：“92年中央确定开展载人航天工程，当时是考虑到这个工程规模宏大，持续的时间很长，所以当时就确定这个工程分三个阶段，也就是三
步走的计划，第一步的计划，主要是要突破关键技术，确定方案，创建，研制和实验的条件，然后进行飞行实验，实现载人航天飞行的历史性突破，这是第一步。”
王永志说，2003年10月16号杨立伟乘坐的神舟五号安全返回祖国大陆后，就表明：中国已经完成了载人航天飞行的历史性的第一步，从神舟六号起，载人航天工程开始实施第二步计划。
第二步计划，是继续突破载人航天的基本技术，比如说多人多天的飞行，出舱，就是太空行走，还有空间的交会对接技术，在突破这些技术的基础上，发射空间实验室。第三步就是建立永久性的空间站，这样的话就建成了一个中国的空间航空系统，航天员和科学家可以来往于空间站之间，进行规模比较大的空间科学实验。
王永志介绍说，中国载人航天工程迈出第一步用了11年的时间，这是计划之中的，因为第一步的任务很艰巨：要确定整体方案；要在关键技术方面组织攻关；要创建各种研制实验条件；另外还要建成全国的协作网，把队伍组建和训练好。第二步需要的时间，大体上和实施第一步计划的时间差不多。
中国载人航天工程总设计王永志说：“
(1-14：50) 神舟六号可以说是第二步的第一次飞行实验，所以它具有承上启下的作用，它要解决的问题是在载人航天整个的工程过程中，是必须解决的问题。比如说现在是多人多天飞行，和杨立伟的第一次飞行就不一样了，他就一个人飞行了21小时23分钟，许多的事情要好办得多，人多，时间一长，对环境的控制和生活的保障，就困难得多了，而且这是将来必须要解决的问题，这次要进行全面的考验。”
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