专案小组说，当时“总统府”以机密为由，要求暂缓查核，“审计部”最后以书面建议“总统府”明订机密等级认定及支用制度。

　　为此，“总统府”在二ＯＯ三年间核定“国务机要经费支用程序作业规定”，规定“国务费”由会计处另设专帐，原始凭证依会计法等法令由专人保管；涉及机密部分，由“总统”秘书室指派专人比照办理，无法取得凭证者，得由承办人提供书面文件或其他佐证资料附案备查。

　　不过，特侦组清查陈水扁任内“国务费”使用状况，发现经审计部抽查后，半数“国务费”仍采“机密费”方式处理，由马永成、林德训两位前后任“总统”办公室主任在每月初以领条领回，每年扣除三节约新台币八、九百万元的犒赏后，其余金额多交由前“总统府”出纳陈镇慧交给吴淑珍处置。

　　至于由会计处保管的“机要费”部分。特侦组日前接获由“监察院”所提供的资料，显示马永成在担任“总统”办公室主任初期，曾以“机密费”不足为由，将每月未用毕的“机要费”移作“机密费”使用。经审计单位查核制止后，马永成再以检附机密资料的方式领取“机要费”。

　　专案小组指出，由于马永成这种领取手段再次受阻，吴淑珍才自二ＯＯ二年七月起，以搜集他人发票的方式，核销“国务费”“机要费”（前“高检署”查黑中心检察官陈瑞仁所称的“非机密费”），至二ＯＯ六年三月止，总计诈领一千四百余万元新台币的“国务费”。

　　专案小组表示，特侦组掌握这份资料后，认为马永成涉嫌协助陈水扁、吴淑珍诈领公款，并非毫不知情，所涉案情不仅查黑中心所起诉的伪造文书罪，十一月四日将他列为贪污治罪条例侵占公款罪、利用职务诈取财物罪被告，并声押获准。

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