最近一次确切知道本·拉登躲藏在哪里还是在阿富汗战争后期，当时本·拉登被逼到阿东部的托拉博拉山区，美军虽然联合阿富汗部队在那里发动大规模攻势，但还是让他溜掉了。
据《亚洲时报》报道，2001年11月17日，随着塔利班政权土崩瓦解，拉登及其家人在25辆丰田“陆地巡洋舰”的护卫下离开阿富汗东部的贾拉拉巴德，向托拉博拉山区进发。
11月下旬，在托拉博拉一个寒冷的岩洞里，拉登向环绕在他身边的最勇猛顽强和最忠诚的也门战士发表了一次激动人心的讲话。
据阿布巴卡尔(后来被阿富汗游击队俘虏的拉登的战士之一)透露，拉登当时告诫他们要立场坚定并做好牺牲的准备。他说：“很快我就会再来看你们”。几天后，大约是在11月30日，拉登与他的4名也门保镖离开托拉博拉向巴部落地区的帕拉奇纳村庄进发。这一路畅通无阻，从此他们杳无音信。
到美国的B-52轰炸机开始无情地扫荡的时候，拉登已离开托拉博拉，不少阿富汗穆斯林游击队员证实，他们曾于11月下旬在其他地方看到过拉登。阿富汗军阀、时任东苏拉(传统决策委员会)所谓的法治部长的哈兹拉特·阿里就曾被五角大楼派来追捕托拉博拉的拉登和“基地”组织成员。他拿了美国大把美元，但几乎没有与美军地面特种部队接触过。
关键的问题是，尽管拉登已在巴基斯坦，国防部长拉姆斯费尔德却指令佛罗里达的美军中央司令部指挥官汤米·弗兰克斯将军以推翻萨达姆为首任。鲍勃·伍德沃德在他的著作《攻击计划》中写道：“12月1日，拉姆斯费尔德通过参谋长联席会议主席向弗兰克斯传达了一个最高机密指令，要求他根据各指挥官的评估制定一个新的伊拉克作战计划。这份2页的指令称，拉氏想知道弗兰克斯将如何采取军事行动铲除萨达姆、消除任何可能的大规模杀伤性武器威胁并切断他给恐怖分子的支援。”
同样在12月初，负责阿富汗东部情报活动的巴尔迪瓦尔深感困惑：五角大楼为何不下令封锁托拉博拉通往外部的所有通道？要知道受雇于美国的哈兹拉特·阿里的游击队员对它们了如指掌。在拉登逃之夭夭后，托拉博拉一战只抓到了几名阿拉伯战士，这些人后来与许多阿富汗旁观者一道被送往关塔那摩监狱。
因此这是五角大楼和白宫的重大失误。托拉博拉行动的失败有两方面原因：第一，五角大楼将阿富汗东部的作战任务外包给了错误的军阀；第二，白宫和五角大楼的注意力已经转移到了萨达姆身上。钟和
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