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湖南已完成20例新冠病毒标本测序,均为德尔塔毒株

湖南已完成20例新冠病毒标本测序,均为德尔塔毒株
2021年08月02日 17:57 湖南省政府门户网

  原标题:湖南已完成20例新冠病毒标本测序,均为德尔塔毒株

  来源:湖南省政府门户网

  

  自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控中心已完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株,与南京高度同源。

  

  5天时间已完成20例标本测序

  据省疾控中心检验科科长湛志飞介绍,基因组测序可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,已成为研究疾病暴发的重要工具。

  通过构建进化树,研究不同患者病毒遗传序列变化,能在分子生物学层面揭示病毒的传播方式,分析新冠病毒的进化来源,研究新冠病毒的致病病理机制,为控制疫情暴发提供科学依据。

  通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据进行比对,可以初步判断其地域来源。将序列与既往病例序列进行比对,如果序列在同一进化树分支上,则可以判断这些病例是否来自同一传播链或传染源。

  面对此次疫情,从7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控已完成20例标本测序。

  24小时完成病毒基因测序溯源

  “新冠病毒样本送到实验室后,一般需要经过多个步骤完成检测。”湛志飞称,在接到阳性样本后,工作人员首先进行复核工作,对样本进行核酸提取,再用两种试剂进行核酸检测。

  复核阳性的标本,分别用二代和三代高通量测序技术进行序列测定,为病毒溯源工作设置“双保险”,确保万无一失。

  病毒基因序列测定完成后,工作人员还要马上进行生物信息学分析,将病毒序列与数据库中的序列进行比对,查看有无变异位点,进行同源性比较。

  完成数据比对后,还要及时撰写溯源报告。

  “目前,湖南省疾控中心已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序能力,为湖南省新型冠状病毒疫情以及其他传染病病原体的鉴定和溯源、防控应对提供了强大的技术支撑。”湛志飞介绍,去年10月份才掌握这项技术,以前都是送到国家疾控中心检测。

  目前湖南省疾控中心培养了3名技术骨干,所有的新冠病毒基因组测序都能在24小时内完成,情况复杂的也不会超过48小时。

  根据疫情的变化,只要有标本来,都会在24小时内启动测序流程。

  测序结果与南京高度同源

  7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例标本测序工作以来,省疾控中心立即组织专业技术人员开展测序工作,通过文库制备、簇生成、上机测序与数据比对分析,已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株。

  从国家疾控中心反馈的结果显示,和江苏省报送的南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源。

  根据最新疫情通报,2021年7月20日0时至8月1日24时,湖南省累计报告新型冠状病毒肺炎确诊病例22例(境外输入3例)。

  最新通报:

  湘潭市雨湖区新增报告1例新冠病毒

  确诊病例

  8月2日0:00-13:00,湘潭市雨湖区新增报告1例新冠肺炎确诊病例(普通型)。

  该新增确诊病例为该市30日报告首例确诊病例曾某的家人,于7月24日乘坐常德穿紫河三号游船游穿紫河。

  于7月29日接受集中隔离医学观察,8月2日上午湘潭市第一人民医院新冠病毒核酸检测阳性,经湘潭市疾控中心复核为阳性。

  经市级专家组会诊,诊断为新冠肺炎确诊病例(普通型),目前已转运至市中心医院公共卫生临床中心隔离治疗。

  新增确诊病例主要活动轨迹:

  

  

  7月24日 9:00从雨湖区乘私家车前往常德;20:18与家人乘坐穿紫河三号船夜游约1小时。

  

  7月25日 15:30从常德乘私家车返回湘潭;17:00左右途经益阳南服务区加油站;18:42 到达雨湖区先锋街道鱼汤泡饭饭店;18:43-18:52 乘坐滴滴车(湘C880X1)到雨湖区百姓家园同康园;18:53-19:06 在家;19:07-19:26自驾前往鱼汤泡饭店就餐;19:27-20:11 在鱼汤泡饭就餐;20:12 自驾返回雨湖区云塘街道百姓家园家中,回家后未外出。

  

  7月26日 8:30 从百姓家园步行至三桥北公交站;9:03坐公交车(综保区至万达广场,湘C13725)到河东大道电业局公交站,后进入东方名苑售楼部工作。12:00左右在单位食堂与同事围桌就午餐; 15:40-15:59从河东大道电业局公交站乘坐综保线(湘C 15009)到三桥北下车,上车时戴口罩,下车时未戴口罩;15:59-17:40从三桥北步行至雨湖区城正街道社区卫生服务中心接种新冠疫苗;17:40步行从百姓家园西门回家。

  

  7月27日 7:00—7:10从百姓家园步行至三桥北。7:10-7:30 从三桥北乘坐24路公交车(湘C06696D),双拥广场站下车后,步行到达东方名苑二期项目部。

  

  7:53—8:10 从东方名苑二期项目部乘坐滴滴车前往省建三公司总部(建筑学校对面),滴滴车牌湘C BF606。9:57左右乘坐出租车(湘CXS055)前往东方名苑二期项目部,中午在食堂围桌就餐;14:23-14:40 从河东大道电业局公交站乘坐5路公交车(湘C15735)到体育中心站下车,14:47转乘10路公交车(湘C12153D)到湘潭三兴建筑施工有限公司;15:00-15:50在湘潭三兴建筑施工有限公司办理业务。15:50-16:00 步行至工商银行江麓支行,16:00-16:16在工商银行江麓支行第二个人工窗口办理业务;16:16-16:22步行至雨湖区江麓步步高超市;16:22-16:33 在江麓步步高超市购物;16:39-16:43在江麓广场乘坐45路(105路)湘C12097,在长途汽车站下车,16:47-16:58换乘24路公交车(湘C06621D)在华银站下车。16:58 步行至百姓家园家中。

  

  7月28日8:42—8:50从百姓家园步行至三桥北;8:52-9:00 在三桥北乘坐24路公交车(湘C06678D)在双拥广场站下车,步行至东方名苑二期项目部上班。中午在食堂就餐;17:00-17:20从河东大道电业局公交站乘坐综保线(湘C15006)到三桥北下车;17:20-17:33 步行至新景小区旁绿丰农场购物;17:33 步行至百姓家园家中。

  

  7月29日 上午居家隔离,下午闭环转运至定点场所集中隔离观察。

  请与上述活动轨迹有交叉、

  同乘公交车或网约车的市民

  立即向居住地社区(村组)主动报备

  配合落实健康监测、核酸检测等防控措施

  请大家关注官方权威发布

  不信谣、不传谣、不造谣

  提高防范意识,做好个人防护

  保持安全社交距离

  加快完成新冠疫苗全程接种

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