近日，甘肃省多地相继出现感染奥密克戎变异株病例，自7月8日出现第一例新冠阳性患者之后，确诊病例及无症状感染者持续增加。面对愈加严峻复杂的疫情防控形势，甘肃省迅速落实“动态清零”方针加强重点区域核酸检测，同时积极开展新冠病毒全基因组测序溯源，揭开本轮疫情病毒“真面目”。
省市联动，建立新冠溯源网
从7月19日开始，甘肃省疾病预防控制中心基于华大智造MGISEQ-200和DNBSEQ-E5两款高通量测序仪有序开展新冠病毒全基因组测序工作，先后完成超过60例感染者样本的测序溯源，为疫情科学精准防控提供“一锤定音”的技术支撑。
甘肃省疾病预防控制中心展开基因测序工作
“我们要对全省各地送检的可疑阳性样本进行复核、确认，基于高通量测序技术持续分析病毒发展动态，并对动态发展中的病毒进行分析研判，确认病毒的基因型别及核苷酸位点的变异情况，为病毒溯源提供依据。”甘肃省疾控中心新冠病毒核酸检测组组长、病原生物实验室主任、主任技师于德山介绍。
甘肃省疾病预防控制中心在本次测序完成的大部分样本100X覆盖度均达到99%以上，其数据质量完全满足开展全基因序列分析、监测病毒变异、追踪疫情来源的精准防控需求。而甘肃本土7.08疫情中，华大智造第三次派技术团队携带检测试剂等支援甘肃省新冠病毒的测序工作，且结果表现稳定可靠，也是华大智造新冠病毒靶向测序一站式平台又一次成功助力监测病毒变异的实例。
在甘肃，不但省级疾控中心具备病毒测序溯源能力，部分地市级疾控中心也在不断加强新冠精准防控能力建设。早在疫情之初，天水市疾病预防控制中心就积极引进国产高通量测序设备，搭建新冠病毒全基因组测序和病原微生物快速鉴定流程，同时配备专人负责平台运行。华大智造应用技术支持工程师也提供理论培训、实操带教、远程支持等多种措施，确保天水市疾控真正具备测序平台运行能力。
华大智造MGISP-100RS、MGISEQ-200 在天水市疾控中心
自7月12日开始，天水市疾病预防控制中心基于华大智造MGISP-100RS、MGISEQ-200RS、PFI病原感染快速鉴定系统等对符合测序要求的33例新冠阳性标本进行了基因测序，7月14日，成功完成首次新冠病毒全基因组测序工作，确定病毒分型为BA.2.38。经省疾控中心复核与新冠病毒参考基因组比对，表明测序数据完整、获得病毒全基因组有效序列。
天水市疾控中心有序开展基因测序工作
天水市疾控中心检验科科长雷成江表示：“天水市疾控中心开展的新冠病毒全基因组测序，在市疾控中心检测检验技术方面具有里程碑的意义，标志着天水市初步具备了新冠病毒基因测序能力，为今后新冠肺炎疫情防控和其他传染病的病原体鉴定溯源、应急处置提供了强大的技术支撑。”
在积极助力新冠病毒全基因组测序溯源的同时，华大智造集成式自动化核酸检测平台和自动化设备还支持着甘肃省多地的疫情防控，为当地打造公共卫生“新基建”提供了完整的自动化设备的一站式平台，快速提升核酸检测机动能力的建设。
*文章内容部分来源新甘肃
(来源：新视线)
