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广东省优秀年轻专家 新春经验交流会 隆重举行

广东省优秀年轻专家 新春经验交流会 隆重举行
2023年02月07日 11:09

  [撰文:袁海双] 日前,广东省优秀海外年轻专家新春经验交流会隆重举行。来自清华大学、中科院计算所、中科院信工所、北京大学、浙江大学、武汉大学、剑桥大学、MIT、乔治亚大学等来自高校、科研院所及企业界近300位研究工作者,通过线上直播参与了研讨会。

  会上,来自美国乔治亚大学系De La Fuente博士实验室的张翔宇先生作了题为“细胞生物学和发育生物学的最新研究发展和应用前景简介”的专题报道,引起了众多正面的反响。

  张翔宇是药理学、病理学一颗冉冉升起的新星,年仅26岁的他,虽达到的成就还不能与老一辈研究人员相提并论,但却有着与同龄人相比足以丰富的履历,完全可以称得上是这一行业的小将。

  他的优秀在大学时期就可以窥见一二,2014年九月至2017年六月在英国伦敦帝国理工大学获生物科学学士学位,在此期间学习了各种生物学研究课题,包括微生物学、生态学、生物化学、进化生物学、免疫学、代谢、网络生物学和细胞生物学等。同时还熟悉了python和R语言。2017年九月至2018年九月同校就读生物信息学与理论系统生物学理学硕士,在此期间,更多地了解了目前生物信息学的前沿研究课题,以及生物信息学研究所必需的数学和计算技能。还参与了三个生物信息学研究项目。包括web数据库开发和机器学习相关的项目。

  之后张翔宇投身工作继续磨练自己,2019年一月加入中国广东省深圳市龙岗区华为总部,任算法工程师专攻医学深度学习,工作期间主要从事涉及心脏图像分析深度学习工具开发的项目,经过深度学习代码编写的初步培训,参与了心脏磁共振成像(MRI)的全心脏子结构分割项目。在离职前完成了基于深度学习算法得到的分割来计算心脏容积的方法。2019年八月在De La Fuente博士实验室担任博士研究助理,实验室主要专注于细胞生物学和发育生物学的表观遗传学方面,张翔宇作为第二作者参与发布的“CBX2的缺失会诱导基因组不稳定和衰老相关的染色体重排”“丙戊酸诱导胚胎干细胞分化过程中染色质可及性景观和组蛋白H3核心乙酰化的变化”两篇论文中,主要负责生物图像和测试数据集的分析。在第一篇论文中,他分析了ATAC-seq在对照组小鼠和CBX2敲除小鼠成纤维细胞上的表观遗传学数据。他独自负责解读来自ATAC-seq的原始测序数据,以及识别具有差异富集ATAC-seq信号的基因组位点所涉及的所有处理、分析和可视化任务还负责分析原始RNA-seq数据集,并在ATAC-seq和RNA-seq分析之间进行综合分析,以检查这种差异的可及性是否以及转化为测序时的转录本数量差。在第二篇论文中他对来自对照小鼠和CBX2敲除小鼠胚胎干细胞的ATAC-seq表观遗传学数据进行了处理、分析和可视化。除此之外张翔宇更开发出一个无创的深度学习管道,可以在没有荧光标记的情况下预测活卵母细胞的DNA构型(NSN或SN),并且只使用在普通共聚焦显微镜下拍摄的3D亮场图像。这条管道意味着可以在不损伤活卵母细胞的情况下访问它们的DNA状态。

  张翔宇在生物研究领域的成长,对所有青年都起到了表率作用。也希望他在这一领域能够越走越远,达到一个新的高度。

  (来源:新视线)

责任编辑:孙青扬

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