神舟六号航天员13日先后进行了开关舱门、穿脱压力服、穿舱、抽取冷凝水四大项“在轨干扰力”试验，结果表明航天员较大幅度动作对飞船姿态影响微小，飞船姿态保持良好，姿态控制发动机不需要启动。从此，航天员可自由进行类似幅度动作。
凌晨4时16分，飞船飞行第13圈，在地面指导下，结束了7小时8分钟休息的费俊龙，从轨道舱进入返回舱，将两舱之间的舱门关闭，六七分钟后重新打开。舱门在太空中关闭密
封和快速检漏得到验证，完全正常。
一个多小时后，航天员费俊龙在返回舱内，在规定时间进行了穿脱压力服试验。
14时25分，第20圈，在远望二号测控弧段内，费俊龙从坐椅上起身，拉着扶手、助力绳，头先脚后飘入轨道舱，随后以原来姿势飘回返回舱。聂海胜则从轨道舱到返回舱进行了两次类似动作。航天员在太空中穿舱时，就像鱼儿在水中轻轻游动。3次穿舱试验顺利完成。此前航天员因工作生活需要，曾两次十分缓慢地在两舱之间穿行，但这两次不算正式试验。
17时10分许，轨道舱内的航天员4分钟内连续按动抽取冷凝水开关约百次，地面人员监控了这一切。正常情况下根据舱内湿度变化情况，航天员每隔3小时抽取一次冷凝水。
四项试验取得了基本相同的结果，飞船只有微小摆动，姿态保持正常，姿态控制发动机不需要点火，“在轨干扰力”试验获得成功。飞船系统总体副主任设计师张书庭介绍，这标志着飞船能够承受航天员舱内活动的扰动，以后就不需要再安排类似试验。
试验结果让航天员敢于在太空中做一些幅度较大动作，记者从北京飞控中心大屏幕上看到，费俊龙在穿舱试验后，曾轻松地在返回舱的两个舷窗间较快地飘来飘去，拿着照相机以不同角度拍摄美丽的地球。他的这个动作在神舟五号飞行时是绝对禁止的。
两名航天员能够在太空成功完成上述一系列重要的空间科学实验，有赖于他们良好的身体状况作基矗在飞控大厅医监台上的李勇枝博士介绍说：“从昨天9时上天到现在，两位航天员已经完成了4次进餐，每个人都休息了一次。他们的精神状态非常好，血压、脉搏等各项生理指标正常，反应敏捷，没有出现任何空间运动病的反应。”
费俊龙于凌晨4时16分结束了大约7小时8分钟的睡眠；13时05分，聂海胜结束7个多小时的睡眠，两位航天员休息后还分别进入轨道舱进行了其他科学实验。航天员和地面科技人员对各项实验获取的数据作了详细记录。
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