9月16日，国际原子能机构（IAEA）召开年度大会，日韩两国围绕东京电力公司福岛第一核电站的污水排放问题，在一般性辩论中展开交锋，相互指责。

根据日本共同社17日报道，污水排放问题有关“含放射性物质的污水”。韩国方面使用了“核污水”的措辞，强调处理水排入大海的恐怖感；日本方面则否定了韩方说法，称这是罔顾事实。

此前，据路透社10日报道，时任日本环境相原田义昭表示，运营福岛第一核电站的东京电力公司将不得不把核电站污水排入太平洋。韩国上月曾召见日本公使并递送照会，就核污水排放一事表示担忧，并要求日方确认是否有这样的计划。日本政府当时答复称，结论尚未确定。

根据共同社报道，日本IT与科学技术担当相竹本直一不点名韩国地指出，围绕被放射性物质污染的水的处理问题，日本“受到了没有科学依据的批评”。韩国科学技术信息通信部第一次官文美玉则强调，由于核污水处置方法尚未确定，“恐怖和不安正在全世界高涨”。

共同社指出，文美玉提及环境受害的措辞让人联想到高活度核污水排入大海，文美玉据此要求国际原子能机构赴当地展开调查。日本代表团“指正”称核污水将获得净化处理，同时反驳韩方，称污水的处置方法仍未确定。日方还表示将继续面向国际社会保持透明度，与国际原子能机构合作，妥善应对情况。然而韩方没有更改“核污水”的措辞，并对日方立场加以反驳。双方持续交锋。

继在世界贸易组织上有关出口管制问题的争端、在国际奥委会（IOC）围绕东京奥运会和残奥会上“旭日旗”的处理矛盾之后，日韩在国际机构的对立进一步扩大。由于近邻国家核电站核查的问题涉及主权，关系持续恶化的日韩两国间的协调工作颇为棘手。国际原子能机构消息人士表示：“日韩关系恶化到如此地步，令人吃惊。”