这次修改政协章程对推动人民政协事业发展，坚持和完善中国共产党领导的多党合作和政治协商制度，建设社会主义政治文明具有十分重要的意义。
切实加强和改善了中国共产党对人民政协的领导。把“三个代表”重要思想写入政协章程是这次修改章程的一个重要贡献。中共十六大已经把“三个代表”重要思想确立为全党、全国人民建设中国特色社会主义的共同思想基础和根本指针。人民政协作为我国政治体
制的重要组成部分，明确把“三个代表”重要思想同马列主义、毛泽东思想、邓小平理论一道写进章程，体现了时代对人民政协事业发展的必然要求。同时，这次修改章程还写进了促进社会主义物质文明、政治文明和精神文明协调发展以及社会主义事业的建设者等中共十六大提出的重大理论观点和重大方针政策，这些都有利于人民政协更好地坚持党的领导，贯彻落实党的路线、方针和政策。
深化了对人民政协性质、地位和职能的认识。这次修改章程，对人民政协的性质进行了更规范、更完整的阐述，有利于人们对政协性质的准确认识和完整把握。明确了团结和民主是政协的两大主题，这是中共中央关于新时期人民政协理论和实践的重大发展成果，把这一成果写入总纲，总揽全篇、贯彻始终，对人民政协履行职能、开展工作具有重大意义。
提高了政协工作的规范化、制度化和程序化水平。近些年来，全国政协和各级地方政协，在围绕中心、服务大局，突出特点、发挥优势，卓有成效地履行政治协商、民主监督、参政议政职能的同时，在加强政协自身建设，完善政协工作机制，规范工作程序，密切与党政工作联系，充分调动委员积极性等方面进行了大量的探索和实践，积累了许多新鲜经验。全国政协高度重视总结这些实践经验，广泛听取各级政协的意见，进行了深入的研讨。围绕这些问题进行的重要的修改，将有力地促进各级政协组织建立科学有序的工作机制，切实搞好自身建设。
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