航天员分系统

航天员系统主要任务是选拔、训练航天员，并在训练和载人飞行任务中，对航天员实施医学监督和医学保障。在北京建设了航天员选训中心，研制了舱内航天服，以及航天员地面训练模拟器等大型训练设备。

有效载荷分系统

应用系统的有效载荷应用中心采用分布式计算机系统，数据通信前端机采用并行双工方式，采用了机群技术、并行数据库技术，建立相对完整的通信指挥调度系统，具备运控计划生成和调度、多种有效载荷数据并行处理分发功能，可支持多有效载荷、多数据流、多艘飞船任务同时运行。[详细]

电源分系统

飞船电源分系统主要作用是为飞船的正常运转提供电力保证，贯穿于推进、返回和轨道三个舱中，是一个大的电源系统，并网技术难度相当大。飞船上的推进系统有不少发动机采用的是双阻元燃料，还有数字压缩图像和话音技术，即天地往返通信系统，也是关系到航天员在天上与地面通信联络及地面指挥监控航天员的十分重要的系统。[详细]

推进分系统

神舟飞船设备舱的尾部是飞船的推进系统。主推进系统由4个大型主发动机组成，它们在推进舱的底部正中。在推进舱侧裙内四周又分别布置了4对纠正姿态用的小推进器，说它们小是和主推进器比，与其他辅助推进器比它们可大很多。另外推进舱侧裙外还有辅助用的小型推进器。[详细]

制导导航和控制分系统

飞船制导导航和控制系统的关键作用就是返回控制，在飞船发射和运行的过程中，飞船姿态、轨道、控制部件、飞船环境等不可避免会产生误差，返回控制可以对所有的误差进行调整，确保飞船安全返回地面。[详细]

仪表照明分系统

神舟六号仪表与照明分系统由中国航天科技集团公司五院510所设计完成，主要是飞船上各主要分系统工程参数的显示设备，飞行过程中重要事件的语音通报、作息提示、时间显示设备等。[详细]

结构和机构分系统

结构与机构分系统的任务是：承担完成飞船结构构型、承载与支撑、结构密封与放热、连接与分离、着陆缓冲任务。“神舟”飞船采用轨道舱、返回舱和推进舱组成的三舱方案，载人飞行结束后，其轨道舱可继续留轨运行半年时间，开展空间对地观测和空间技术实验，同时还可以作为空间交会对接任务的目标飞行器。[详细]
[神舟飞船结构][轨道舱][返回舱][推进舱][附加段]

热控分系统

热控系统主要作用是使飞船内保持一定的温度，藏在飞船肚子里的航天员享受着“四季如春”舒适环境。“神舟”六号载人飞船舱内温度被自动控制在17至25摄氏度，航天员也可进行手动调节。飞船飞行过程中，向阳面舱外温度超过100摄氏度，背阳面为零下100摄氏度。[详细]

环境控制与生命保障系统

环控生保系统应用在载人飞船临射待命、发射段飞行、轨道飞行、返回段飞行和着陆后等待回收的各个阶段，为航天员（或载荷专家）创造合适的舱内生存环境条件，保障其在空间飞行的特殊环境下安全生活和正常地工作。该系统应有两大功能：其一，控制环境功能，实现座舱的内环境控制，即座舱大气压力控制、气体成分控制、大气湿度控制和大气温度控制。解决座舱的火情、噪声和辐射问题。其二，生命保障功能，为航天员提供各种生活支持设施，解决空间飞行条件下，特别是轨道飞行的微重力条件下航天员的进食、饮水和处理个人卫生所遇到的特殊困难。[详细]

测控通讯分系统

在神舟飞船实施的整个过程中，测控通信网始终掌管着神舟飞船的一举一动。从它的发射“启程”开始，测控通信网就通过强大的捕捉机构和能力，始终对神舟号飞船的运动和工作状态进行着严密的测量和控制。航天测控通信网由一般航天控制中心、分布在世界各地的若干航天测控站(包括海上测量船)以及空中空间测控平台(如测量飞机、跟踪与数据中继卫星等)组成。

应急救生系统

在飞船运行的不同阶段需要采用不同的应急救生手段，在发射阶段采用弹射座椅或可分离头部；轨道运行阶段由另一载人飞船靠近出故障的飞船，并与之对接，或航天员乘坐载人机动装置飞到另一艘载人飞船上去，也可以提前返回；返回阶段采用弹射座椅或分离座舱，将航天员与飞船分离。[详细]

着陆回收分系统

着陆场系统是宇航员安全返回地面的最后一个环节，也是最为关键的一个环节之一。它的主要任务是：飞船在太空飞行后，从返回舱再入大气层开始，利用先进的无线电测量系统，对目标进行捕捉、分析和落点预报，然后组织迅速逼近返回舱，并且对返回舱进行处置，且将其安全运回基地。

数据管理分系统

神舟飞船航天员座椅下方的一个位置，安装着一个橘红色的小匣子，这个被称为应急数据记录器的小东西就是所谓的“黑匣子”。“黑匣子”主要用于记录飞船飞行的重要数据，例如：舱内气压、温度、湿度，飞船姿态，各种设备工作状态，航天员在仪表上的操作等。飞船上的所有数据，进行分类变换等处理后，形成三类数据，第一类由仪表显示，第二类由发射机发回地面，第三类就分给“黑匣子”。[详细]